285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2259 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 259 aa  530  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  57.94 
 
 		 231 aa  272  4.0000000000000004e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  53.81 
 
 		 232 aa  254  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  57.96 
 
 		 240 aa  253  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  51.95 
 
 		 231 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  50.63 
 
 		 238 aa  242  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  52.63 
 
 		 244 aa  241  7e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  51.5 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  53.39 
 
 		 245 aa  240  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  47.95 
 
 		 207 aa  209  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  48.61 
 
 		 492 aa  203  3e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  48.87 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  44.8 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  48.83 
 
 		 238 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  41.53 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  45.25 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  45.25 
 
 		 213 aa  183  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  44.14 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  47.06 
 
 		 365 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  43.89 
 
 		 240 aa  178  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  47.06 
 
 		 365 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  48.66 
 
 		 383 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  44.91 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  49.54 
 
 		 234 aa  178  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  47.89 
 
 		 221 aa  178  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  44.78 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  48.39 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  45.83 
 
 		 213 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  45.71 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  46.01 
 
 		 225 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  45.81 
 
 		 238 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  45.33 
 
 		 365 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  45.85 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  45.85 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  45.85 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  45.56 
 
 		 228 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  44.02 
 
 		 214 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  41.67 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  39.73 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  43.69 
 
 		 213 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  43.81 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  47.44 
 
 		 221 aa  169  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  43.38 
 
 		 213 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1756  lipoate-protein ligase B  40.51 
 
 		 227 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  40.89 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  41.63 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  41.23 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  40.83 
 
 		 213 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  45.16 
 
 		 235 aa  166  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  41.1 
 
 		 213 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  43.96 
 
 		 227 aa  165  6.9999999999999995e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  40.72 
 
 		 222 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  42.53 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  46.5 
 
 		 230 aa  163  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  42.92 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  40.93 
 
 		 239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  40.93 
 
 		 239 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  48.11 
 
 		 202 aa  162  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  42.17 
 
 		 246 aa  162  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  43.78 
 
 		 233 aa  162  7e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  42.2 
 
 		 211 aa  161  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  44.55 
 
 		 232 aa  161  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  40.37 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  42.92 
 
 		 227 aa  158  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  47.03 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  38.55 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  45.83 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  43.84 
 
 		 277 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1267  lipoate-protein ligase B  43.72 
 
 		 221 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118424  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  45.45 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16370  lipoate-protein ligase B  41.99 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0223931  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51454  lipoate-protein ligase  49.07 
 
 		 157 aa  149  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.444704  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  42 
 
 		 244 aa  149  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  39.91 
 
 		 209 aa  148  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  39.32 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  38.89 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  46.37 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  36.28 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13360  lipoate-protein ligase B  39.91 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  36.93 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  41.82 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  39.21 
 
 		 535 aa  142  6e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  42.35 
 
 		 223 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  43.82 
 
 		 218 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  36.49 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  43.09 
 
 		 243 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03991  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.28494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1741  lipoate-protein ligase B  36.8 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0367071 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04631  lipoate-protein ligase B  37.07 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451371  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  44.75 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  43.02 
 
 		 204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  38.43 
 
 		 218 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 		 236 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  43.39 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  41.97 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  42.46 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  43.09 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0659  lipoate-protein ligase B  36.97 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  40.1 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>