More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4606 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 242 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  92.2 
 
 		 205 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  72.2 
 
 		 205 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  59.02 
 
 		 205 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  43.96 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  45.86 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  41.95 
 
 		 205 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  42.19 
 
 		 203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  42.86 
 
 		 203 aa  139  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  40.72 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  39.81 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  45.99 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  38.02 
 
 		 206 aa  131  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4677  lysine exporter protein LysE/YggA  38.1 
 
 		 203 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4152  lysine exporter protein LysE/YggA  38.54 
 
 		 203 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2130  lysine exporter protein LysE/YggA  37.81 
 
 		 202 aa  115  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000391872  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  37.04 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.37 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.36 
 
 		 203 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  30.94 
 
 		 204 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.74 
 
 		 230 aa  99  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0621  LysE family protein  41.6 
 
 		 217 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1208  LysE family translocator protein  41.6 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1281  LysE family translocator protein  41.6 
 
 		 203 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18583  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1358  LysE family protein  41.41 
 
 		 203 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2472  LysE family protein  41.41 
 
 		 203 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.082911  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0342  LysE family protein  41.41 
 
 		 203 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0949  LysE family protein  41.41 
 
 		 203 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 207 aa  95.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  31.28 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  32.66 
 
 		 206 aa  89  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  34.5 
 
 		 208 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  31.55 
 
 		 210 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  31.55 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0198  amino acid transporter LysE  31.55 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0004  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.309415  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  32.52 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3890  lysine exporter protein (LysE/YggA)  39.06 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.86 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3025  amino acid transporter LysE  28.92 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0495687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.66 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  31.73 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.04 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.86 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.63 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  31.37 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2641  hypothetical protein  32.64 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.774137 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  30.26 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.24 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  31.72 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  31.72 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  31.07 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  28.79 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0236  lysine exporter protein LysE/YggA  31.92 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  32.49 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  34.16 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0140  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.58 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.82 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2902  lysine exporter protein LysE/YggA  31.1 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1545  amino acid transporter LysE  32.45 
 
 		 204 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  29.82 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0051  amino acid transporter LysE  25.68 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2570  lysine exporter protein LysE/YggA  31.07 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00200022  unclonable  0.0000000406824 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0918  lysine exporter protein LysE/YggA  32.11 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2195  lysine exporter protein LysE/YggA  32.47 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3615  lysine exporter protein LysE/YggA  30.96 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0587499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1052  lysine exporter protein LysE/YggA  32.24 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7098  RhtB family transporter  29.69 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.38 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  31.98 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  33.68 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  26.79 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.483142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  30.15 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.78 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2802  lysine exporter protein LysE/YggA  29.53 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1525  transporter, putative  35.71 
 
 		 173 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2698  putative threonine efflux protein  26.84 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.575587  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0680  amino acid transporter LysE  32.45 
 
 		 207 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  24.88 
 
 		 213 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.72 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4190  Rht family transporter amino acid efflux protein  33.52 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  0.194107 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.19 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  25.23 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2160  lysine exporter protein LysE/YggA  30.29 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17805  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  25.23 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  25.23 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  26.9 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2618  lysine exporter protein LysE/YggA  28.95 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  31.18 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  27.69 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1954  amino acid transporter LysE  27.8 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1669  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>