More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2023 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2871  cold-shock dead-box protein A  64.33 
 
 
673 aa  853    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.975529  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2023  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
651 aa  1321    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.995582  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0067  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  71.34 
 
 
626 aa  868    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237297  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0850  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.29 
 
 
730 aa  640    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00336665  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1574  DEAD/DEAH box helicase-like  61.04 
 
 
706 aa  647    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226882  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1826  DEAD/DEAH box helicase domain protein  92.13 
 
 
659 aa  1210    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0590  DEAD/DEAH box helicase-like  54.1 
 
 
710 aa  638    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331406 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2893  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.78 
 
 
764 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0900  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.34 
 
 
787 aa  632  1e-180  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00172468  normal  0.0499652 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0135  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.97 
 
 
793 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776582  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4366  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.49 
 
 
687 aa  623  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.24 
 
 
644 aa  614  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0120  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  56.58 
 
 
626 aa  607  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0124  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  56.4 
 
 
626 aa  603  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.232236  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0876  DEAD/DEAH box helicase-like  51.85 
 
 
659 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0179  DEAD/DEAH box helicase  51.29 
 
 
679 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.970165  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1589  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.67 
 
 
609 aa  591  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1485  ATP-dependent RNA helicase  63.26 
 
 
602 aa  588  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16789  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3218  DEAD/DEAH box helicase-like  54.38 
 
 
691 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4667  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.64 
 
 
545 aa  588  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.528462  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1119  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.75 
 
 
596 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.538016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.75 
 
 
545 aa  581  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4525  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.23 
 
 
691 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4919  putative DEAD-box cold-shock protein, ATP-independent RNA helicase  55.52 
 
 
656 aa  580  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.730754  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2184  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.15 
 
 
776 aa  579  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.383881 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.2 
 
 
593 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.172046 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1386  DEAD/DEAH box helicase  55.35 
 
 
677 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1844  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.45 
 
 
574 aa  555  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360564  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1832  DEAD/DEAH box helicase-like protein  50 
 
 
610 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00214348  normal  0.596692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.59 
 
 
583 aa  537  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0260  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.71 
 
 
577 aa  530  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4914  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.65 
 
 
568 aa  522  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4450  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.65 
 
 
568 aa  521  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.181916 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2584  DEAD/DEAH box helicase-like  51.48 
 
 
590 aa  516  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.780763  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2913  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.02 
 
 
585 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898805  normal  0.138469 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.43 
 
 
567 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.323707  normal  0.0708927 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.72 
 
 
505 aa  491  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.295607 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.45 
 
 
565 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.629149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3142  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.45 
 
 
565 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3044  DEAD/DEAH box helicase-like  50.87 
 
 
565 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4213  DEAD/DEAH box helicase-like  61.09 
 
 
340 aa  330  6e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.985867  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.58 
 
 
558 aa  295  1e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000225477  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.13 
 
 
595 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.61 
 
 
640 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.65 
 
 
527 aa  270  8e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.3 
 
 
640 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.56 
 
 
527 aa  268  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.3 
 
 
640 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.24 
 
 
637 aa  269  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.3 
 
 
640 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.14 
 
 
640 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.37 
 
 
584 aa  266  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.9 
 
 
622 aa  266  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3577  ATP-dependent RNA helicase DbpA  42.73 
 
 
473 aa  265  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2820  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.81 
 
 
556 aa  265  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00179058  normal  0.0521879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.9 
 
 
622 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14060  DNA/RNA helicase, superfamily II  34.22 
 
 
669 aa  264  4.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1046  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.77 
 
 
627 aa  263  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.835563  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.24 
 
 
590 aa  263  6e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.74 
 
 
619 aa  262  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.05 
 
 
532 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.59 
 
 
529 aa  262  2e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.85 
 
 
546 aa  260  4e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.43 
 
 
541 aa  260  4e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.58 
 
 
533 aa  260  5.0000000000000005e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28600  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.02 
 
 
570 aa  259  8e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.219312 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.31 
 
 
571 aa  259  8e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0067613  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.4 
 
 
538 aa  258  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.21 
 
 
599 aa  258  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3020  ATP-dependent RNA helicase DbpA  40.36 
 
 
465 aa  258  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.93907  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1868  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.61 
 
 
559 aa  257  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0935982  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.59 
 
 
623 aa  257  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3847  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.61 
 
 
559 aa  257  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.460611  normal  0.310213 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.49 
 
 
546 aa  256  7e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.26 
 
 
482 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0704  ATP-dependent RNA helicase  30.82 
 
 
601 aa  256  1.0000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.91 
 
 
550 aa  254  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2144  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.97 
 
 
560 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101709  normal  0.616746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.77 
 
 
560 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.31662  normal  0.276111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.87 
 
 
590 aa  253  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0666  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.92 
 
 
625 aa  253  9.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.477317  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.66 
 
 
678 aa  253  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2250  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.4 
 
 
574 aa  252  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.460178  normal  0.714612 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.11 
 
 
565 aa  252  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0650  ATP-dependent RNA helicase DbpA  42.64 
 
 
468 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  30.35 
 
 
589 aa  252  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2473  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.62 
 
 
530 aa  251  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14791  putative ATP-dependent RNA helicase  30.81 
 
 
589 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.459404  normal  0.230286 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0647  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.81 
 
 
589 aa  251  4e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.176165  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0603  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.41 
 
 
591 aa  251  4e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  34.52 
 
 
561 aa  251  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1477  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.71 
 
 
559 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682084  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2752  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.32 
 
 
694 aa  250  6e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0117058 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.79 
 
 
634 aa  250  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.04 
 
 
643 aa  249  8e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.9 
 
 
610 aa  249  8e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.71 
 
 
561 aa  249  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.38 
 
 
538 aa  249  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.240435  decreased coverage  0.00164487 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.71 
 
 
530 aa  249  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.14 
 
 
538 aa  249  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>