More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1646 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1646  ABC transporter related  100 
 
 		 352 aa  712    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  72.24 
 
 		 353 aa  520  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  46.69 
 
 		 343 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  49.53 
 
 		 366 aa  298  9e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  42.03 
 
 		 356 aa  288  8e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  44.7 
 
 		 348 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  45.45 
 
 		 363 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  49.48 
 
 		 363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  42.68 
 
 		 367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  49.69 
 
 		 358 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  44.87 
 
 		 363 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  46.37 
 
 		 356 aa  279  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  45 
 
 		 360 aa  279  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.54 
 
 		 363 aa  278  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  46.01 
 
 		 368 aa  278  9e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  45 
 
 		 360 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  45 
 
 		 360 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  41.41 
 
 		 376 aa  275  6e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  46.58 
 
 		 353 aa  275  7e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  45 
 
 		 360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  45 
 
 		 360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  45.01 
 
 		 342 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  44.44 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  46.18 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.03 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  43.83 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  44.89 
 
 		 342 aa  269  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  43.52 
 
 		 347 aa  269  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  45.34 
 
 		 372 aa  268  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  45.79 
 
 		 352 aa  268  8.999999999999999e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  46.88 
 
 		 365 aa  268  8.999999999999999e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  44.25 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  53.57 
 
 		 353 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  43.62 
 
 		 347 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  51.97 
 
 		 342 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1464  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  41.79 
 
 		 350 aa  266  5e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  44.83 
 
 		 353 aa  266  5.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  41.87 
 
 		 386 aa  265  5.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.31 
 
 		 346 aa  266  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  53.11 
 
 		 353 aa  265  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  52.92 
 
 		 341 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2416  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.99 
 
 		 338 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  52.87 
 
 		 372 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  46.18 
 
 		 353 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.06 
 
 		 362 aa  263  3e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  44.83 
 
 		 353 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.72 
 
 		 352 aa  262  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.26 
 
 		 349 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.64 
 
 		 356 aa  262  6.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  52.7 
 
 		 353 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  45.65 
 
 		 339 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2398  ABC transporter  42.09 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0142955  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  44.62 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  44.44 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  43.57 
 
 		 353 aa  261  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3616  ABC transporter related  41.89 
 
 		 356 aa  261  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  42.53 
 
 		 344 aa  261  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.87 
 
 		 382 aa  260  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  42.77 
 
 		 342 aa  261  2e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  43.73 
 
 		 352 aa  260  3e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  44.92 
 
 		 346 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  44.92 
 
 		 346 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.78 
 
 		 377 aa  260  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4990  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.24 
 
 		 363 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  44.92 
 
 		 346 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2664  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.78 
 
 		 384 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  43.25 
 
 		 363 aa  259  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  51.79 
 
 		 348 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  47.65 
 
 		 348 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.59 
 
 		 383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  47.65 
 
 		 348 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  43.94 
 
 		 363 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2005  ABC transporter related  43.95 
 
 		 378 aa  259  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833855  normal  0.0467613 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6149  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.43 
 
 		 360 aa  259  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0149  ABC transporter-like protein  52.52 
 
 		 343 aa  259  7e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.661807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8158  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  49.82 
 
 		 377 aa  259  7e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  46.18 
 
 		 347 aa  258  8e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  46.92 
 
 		 350 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  46.92 
 
 		 350 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  46.92 
 
 		 350 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0320  ABC transporter related protein  44.85 
 
 		 382 aa  258  9e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.85 
 
 		 360 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  49.81 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2630  ABC transporter related  43.95 
 
 		 378 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0792503  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  43.57 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  47.32 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  44.41 
 
 		 350 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  52.3 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  45.36 
 
 		 358 aa  257  2e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  40.85 
 
 		 383 aa  257  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  44.41 
 
 		 347 aa  256  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0179  ABC transporter related  51.49 
 
 		 388 aa  256  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6502  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.86 
 
 		 351 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.85 
 
 		 402 aa  256  4e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2487  ABC transporter related  40.64 
 
 		 379 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00872773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  51.9 
 
 		 527 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.16 
 
 		 360 aa  256  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1511  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  53.14 
 
 		 358 aa  256  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280689  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3217  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.45 
 
 		 352 aa  256  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>