More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6570 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  92.44 
 
 
344 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
344 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  72.67 
 
 
346 aa  536  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  64.95 
 
 
330 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  47.37 
 
 
341 aa  320  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  42.48 
 
 
349 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3469  oxidoreductase domain-containing protein  39.17 
 
 
370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0389  oxidoreductase domain protein  37.69 
 
 
364 aa  220  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198864  decreased coverage  0.00485328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1146  oxidoreductase domain protein  39.05 
 
 
365 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17800  predicted dehydrogenase  35.65 
 
 
380 aa  200  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.50383  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27070  predicted dehydrogenase  34.97 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314063  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1859  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 
355 aa  122  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190485  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4112  oxidoreductase-like  28.07 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1468  oxidoreductase-like  26.37 
 
 
373 aa  90.5  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582127  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  28.11 
 
 
351 aa  90.5  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  35.33 
 
 
382 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  34.23 
 
 
382 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  22.65 
 
 
347 aa  84  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  24.91 
 
 
368 aa  82.8  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.51 
 
 
359 aa  82.8  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  27.32 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2038  oxidoreductase domain-containing protein  28.37 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.488565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  27.04 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  24.85 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  24.85 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
373 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  23.26 
 
 
360 aa  79.3  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  23.26 
 
 
360 aa  79.3  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0322  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 
356 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  25.08 
 
 
362 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  26.54 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.15 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  25.48 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  36.18 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  25.51 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  34.62 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.05 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 
431 aa  76.3  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  26.54 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  25.94 
 
 
431 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  29.07 
 
 
383 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  25.53 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  27.98 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 
377 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  25.89 
 
 
377 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.11 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  24.4 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  23.91 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  23.19 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  23.76 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  28.49 
 
 
421 aa  72.4  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  29.85 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  23.01 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  24 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  29.93 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  30.89 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  21.37 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  22.91 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  26.44 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  24.42 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  35.57 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  24.66 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  23.74 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  20.99 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1858  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  34.34 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 
391 aa  69.3  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  23.88 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  22.92 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  23.8 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
389 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  25.64 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1379  oxidoreductase-like protein  25.1 
 
 
362 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
367 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  22.59 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  27.54 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  33.53 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  32.06 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  24.84 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0520  oxidoreductase domain-containing protein  25.7 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  25.21 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 
377 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  32.2 
 
 
389 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 
345 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  30.05 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  32.95 
 
 
358 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  23.08 
 
 
337 aa  67  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  28.19 
 
 
383 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  25.37 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  26.86 
 
 
429 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>