More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5901 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
352 aa  713    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  47.81 
 
 
335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  47.37 
 
 
324 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  47.11 
 
 
338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  50.62 
 
 
322 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  44.9 
 
 
332 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  44.9 
 
 
332 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  46.33 
 
 
323 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  46.33 
 
 
323 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  44.59 
 
 
320 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  40 
 
 
322 aa  249  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  42.81 
 
 
366 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  39.85 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  33.44 
 
 
328 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  43.01 
 
 
391 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  35.89 
 
 
328 aa  163  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  38.46 
 
 
328 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 
329 aa  159  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  33.33 
 
 
329 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  30.19 
 
 
348 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  30.77 
 
 
327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  31.27 
 
 
327 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  32.57 
 
 
327 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  32.57 
 
 
327 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  34.47 
 
 
326 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  33.22 
 
 
389 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  43.71 
 
 
363 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  35.48 
 
 
322 aa  150  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 
332 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  32.15 
 
 
325 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  36.26 
 
 
336 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  32.9 
 
 
387 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  31.09 
 
 
335 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  29.41 
 
 
335 aa  146  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  34.19 
 
 
390 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  40.59 
 
 
370 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  31.32 
 
 
388 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  32.05 
 
 
335 aa  143  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  37.44 
 
 
369 aa  143  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  35.07 
 
 
336 aa  143  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  29.55 
 
 
332 aa  142  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  31.88 
 
 
367 aa  142  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  33.46 
 
 
328 aa  142  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  33.2 
 
 
325 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  32.77 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 
330 aa  135  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  28.38 
 
 
321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  41.05 
 
 
405 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  50 
 
 
388 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  36.51 
 
 
336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  45.77 
 
 
355 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  34.98 
 
 
336 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  39.78 
 
 
428 aa  130  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  31.49 
 
 
308 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  41.88 
 
 
369 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  39.25 
 
 
419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  35.68 
 
 
360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  42 
 
 
401 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  33.94 
 
 
239 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  34.35 
 
 
336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  41.95 
 
 
345 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  37.5 
 
 
427 aa  124  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  43.03 
 
 
425 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  36.14 
 
 
425 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  37.79 
 
 
451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  36.41 
 
 
328 aa  116  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  37.64 
 
 
493 aa  116  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  34.9 
 
 
477 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  36.36 
 
 
468 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  36.57 
 
 
459 aa  115  8.999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  32.38 
 
 
426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  40.97 
 
 
430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  37.71 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  33.51 
 
 
424 aa  106  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.97 
 
 
759 aa  106  7e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  37.06 
 
 
333 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4255  AAA ATPase, central region  41.67 
 
 
688 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  33.87 
 
 
804 aa  102  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31786  peroxisomal assembly protein  42.31 
 
 
1178 aa  101  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02925  microbody (peroxisome) biogenesis protein peroxin 6 (Eurofung)  33.49 
 
 
1476 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.637827  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03110  hypothetical protein  34.92 
 
 
1124 aa  100  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.99 
 
 
738 aa  100  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.85 
 
 
852 aa  99.8  7e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  26.41 
 
 
243 aa  99.4  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.29 
 
 
737 aa  99  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.29 
 
 
737 aa  99  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  31.19 
 
 
810 aa  98.2  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.29 
 
 
736 aa  98.6  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  35.96 
 
 
659 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  39.13 
 
 
412 aa  97.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.02 
 
 
760 aa  97.8  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  38.34 
 
 
412 aa  97.1  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3258  AAA ATPase central domain protein  39.31 
 
 
412 aa  97.1  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69388  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.85 
 
 
735 aa  97.1  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1832  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.16 
 
 
623 aa  97.4  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.72 
 
 
718 aa  97.1  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  36.84 
 
 
371 aa  96.7  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  38.03 
 
 
686 aa  96.7  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  37.65 
 
 
754 aa  96.7  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  34.4 
 
 
703 aa  96.7  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>