140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2108 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 263 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2350  transcriptional regulator, AraC family  82.76 
 
 		 263 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0397043 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  46.69 
 
 		 305 aa  203  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4320  AraC family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400643  normal  0.300736 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0145  transcriptional regulator, AraC family  43.78 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.818844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  37.84 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  38.65 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2898  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 221 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  38.71 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  39.38 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2688  helix-turn-helix domain-containing protein  35.02 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.977146  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0111  AraC family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6058  transcriptional regulator, AraC family  33.72 
 
 		 291 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 239 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  27.84 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.44 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  30.89 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.86 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  29.57 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  33.88 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  28.78 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  28.02 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  30.83 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.27 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  26.48 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  24.61 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.82 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0509  Helix-turn-helix, AraC domain protein  33.88 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.591495 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  26.61 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  25.1 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  21.59 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  23.77 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  22.88 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  29.25 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  23.72 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  27.97 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  23.85 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  20.71 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  32.96 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  22.94 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5515  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0529906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  24.41 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.63 
 
 		 325 aa  52.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  27.54 
 
 		 271 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  22.01 
 
 		 279 aa  52.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  32.4 
 
 		 281 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  40.85 
 
 		 269 aa  52.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  30.77 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2103  AraC family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.63 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  32.8 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1507  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  40.74 
 
 		 504 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102956  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  24.57 
 
 		 277 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  24.62 
 
 		 280 aa  49.3  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 		 268 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 297 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2824  helix-turn-helix domain-containing protein  20.26 
 
 		 251 aa  48.9  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0253929  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  23.26 
 
 		 281 aa  48.9  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  23.42 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6409  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586073  normal  0.525784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3824  transcriptional regulator, AraC family  20.85 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  22.06 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.25 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2581  Helix-turn-helix, AraC domain protein  29.44 
 
 		 300 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1969  transcriptional regulator, AraC family  26.88 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0909841  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6121  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 289 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  36.62 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  27.5 
 
 		 278 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0659  hypothetical protein  27.18 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0955  hypothetical protein  27.18 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3571  hypothetical protein  27.18 
 
 		 277 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3599  hypothetical protein  27.18 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1925  hypothetical protein  27.18 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 278 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 285 aa  45.8  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  33.82 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>