202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1557 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  487  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  42.06 
 
 		 251 aa  194  9e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  46.12 
 
 		 248 aa  178  9e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  42.86 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  42.55 
 
 		 251 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  42.91 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  45.89 
 
 		 246 aa  169  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  38.14 
 
 		 236 aa  141  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  30.19 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  30.19 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  29.6 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  30.77 
 
 		 263 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  29.66 
 
 		 263 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  27.69 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  31.32 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  36.89 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  29.63 
 
 		 244 aa  92.4  6e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  25 
 
 		 242 aa  89.7  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  29.53 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  32.93 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  27.02 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  29.53 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  34.27 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  31.76 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  33.52 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  26.67 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  35.66 
 
 		 284 aa  78.6  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  31.18 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  32.33 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  27.56 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  27.06 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  33.2 
 
 		 281 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  29.46 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  32.35 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  37.04 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  24.8 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  36.3 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  27.95 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  29.33 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  36.3 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  30.05 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  27.69 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  30.05 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  30.05 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  31.33 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  25 
 
 		 262 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  36.09 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  31.7 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  28.93 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  32.57 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  24.69 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  29.06 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  29.06 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  29.55 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  30.9 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  40 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  32.7 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  27.94 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  26.67 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  30.23 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  27.94 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  48.31 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  30.39 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  29.34 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  33.57 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  29.34 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  29.28 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  29.22 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  30.51 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  29.31 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  28.74 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  38.78 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  38.78 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  29.07 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  31.23 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  31.41 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  33.15 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  30.83 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  31.64 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  27.5 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  36 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  30.49 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  33.87 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  30.2 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  29.41 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  29.41 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  29.41 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  29.41 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  24.7 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  29.41 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  29.41 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  29.41 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  29.41 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  29.41 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  28.51 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  26.87 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  26.82 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  37.76 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  28.14 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  28.5 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>