223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5964 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  85.35 
 
 		 208 aa  359  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  78.85 
 
 		 208 aa  345  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  75 
 
 		 206 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  70.71 
 
 		 207 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3791  phage integrase family site specific recombinase  72.12 
 
 		 208 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  70.56 
 
 		 207 aa  297  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  63.96 
 
 		 210 aa  271  5.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  60.87 
 
 		 209 aa  271  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3208  phage integrase family protein  60.1 
 
 		 204 aa  270  9e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0839313  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  60.19 
 
 		 209 aa  266  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  57.97 
 
 		 209 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1978  phage integrase family protein  71.2 
 
 		 238 aa  261  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  57.97 
 
 		 209 aa  259  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2267  phage integrase family protein  57.49 
 
 		 210 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.783329  normal  0.401703 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0217  phage integrase family protein  60.2 
 
 		 200 aa  256  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4790  integrase family protein  57 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3118  phage integrase  56.78 
 
 		 210 aa  251  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2590  hypothetical protein  55.05 
 
 		 210 aa  246  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3817  integrase family protein  60.2 
 
 		 210 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.736864  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6083  integrase family protein  55.56 
 
 		 210 aa  231  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0658  phage integrase protein  52.02 
 
 		 210 aa  228  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  53.33 
 
 		 198 aa  228  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  54.55 
 
 		 210 aa  228  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5291  integrase family protein  54.04 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  54.12 
 
 		 198 aa  224  8e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0261  putative tyrosine recombinase XerD  62.21 
 
 		 175 aa  220  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  51.56 
 
 		 197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1950  phage integrase family protein  52.33 
 
 		 197 aa  214  8e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827298  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4474  integrase family protein  54.64 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  53.65 
 
 		 197 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2164  phage integrase family protein  52.31 
 
 		 198 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  53.65 
 
 		 197 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1123  phage integrase family protein  51.79 
 
 		 198 aa  208  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1181  phage integrase family protein  51.79 
 
 		 198 aa  208  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.820562  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3899  phage integrase family protein  51.79 
 
 		 198 aa  208  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1287  integrase family protein  51 
 
 		 203 aa  207  8e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  48.45 
 
 		 198 aa  195  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4334  phage integrase family protein  50 
 
 		 173 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3446  phage integrase family protein  48.3 
 
 		 163 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.993422  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0365  hypothetical protein  79.27 
 
 		 103 aa  143  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0153  phage integrase family site specific recombinase  49.61 
 
 		 141 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.246008  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1167  hypothetical protein  60.26 
 
 		 78 aa  102  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6970  hypothetical protein  73.44 
 
 		 88 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0280  phage integrase family site specific recombinase  67.69 
 
 		 66 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0790  hypothetical protein  46.32 
 
 		 130 aa  96.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.517667  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2576  hypothetical protein  47.89 
 
 		 89 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  28.8 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1166  hypothetical protein  50.79 
 
 		 76 aa  77.8  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  29.67 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  28.57 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  28.11 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  28.11 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  27.17 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  28.57 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2876  integrase family protein  30.89 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  28.57 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  27.63 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  27.56 
 
 		 180 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  26.01 
 
 		 189 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  27.56 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  25.71 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  26.95 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  27.47 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.69 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  28.1 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  25.57 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.39 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.39 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  27.45 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  24.86 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  25.97 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  24.28 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  26.77 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  28.16 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3459  hypothetical protein  54 
 
 		 55 aa  54.7  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  25.31 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  27.1 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.4 
 
 		 328 aa  54.3  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  23.3 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2286  phage integrase  23.08 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000274502  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  26.37 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4392  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  27.1 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0969  integrase family protein  30.89 
 
 		 245 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2243  integrase family protein  23.6 
 
 		 634 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308356 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  26.49 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  26.26 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0378  integrase family protein  27.46 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0382  site-specific recombinase, phage integrase family  23.3 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0781  integrase family protein  30.93 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1117  phage integrase  27.74 
 
 		 369 aa  52.8  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.343038  decreased coverage  0.00190839 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4494  phage integrase family site specific recombinase  22.86 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 301 aa  52  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0719  integrase family protein  29.9 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  24.7 
 
 		 293 aa  51.6  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4641  phage integrase family site specific recombinase  21.71 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4995  phage integrase family site specific recombinase  21.71 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4865  site-specific recombinase, phage integrase family  21.71 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  23.81 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>