More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5353 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5353  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 330 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5831  LuxR family transcriptional regulator  59.31 
 
 		 276 aa  272  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5861  LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.971396 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5380  regulatory protein, LuxR  42.05 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869493  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1120  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.41 
 
 		 219 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.118956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1028  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.41 
 
 		 222 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.146412  normal  0.260968 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1185  transcription regulator protein  34.41 
 
 		 222 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  0.600184 
 
 
-
 
NC_003296  RS03679  transcription regulator protein  33.91 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000906887  normal  0.0907157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3767  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.14 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4844  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.14 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3718  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.74 
 
 		 231 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0262455  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4795  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.07 
 
 		 221 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.180506 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0338  negative regulator of exopolysaccharide production transcription regulator protein  61.54 
 
 		 236 aa  86.7  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5646  putative LuxR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.387707 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1571  XRE family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 227 aa  67  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  26.57 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.31 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 218 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0582  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 218 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0555  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.7 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.27 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.07 
 
 		 218 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4084  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.27 
 
 		 218 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.27 
 
 		 218 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6044  two component transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 		 226 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2357  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.81 
 
 		 234 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 262 aa  53.1  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3347  two component LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 234 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.563314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  36.9 
 
 		 212 aa  53.1  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.43 
 
 		 215 aa  53.1  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.97 
 
 		 227 aa  52.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06950  LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 496 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.490761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0636  LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 496 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  36.9 
 
 		 233 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  40.85 
 
 		 595 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 201 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5542  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.14 
 
 		 212 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.448293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4981  two component LuxR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 244 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2996  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 595 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.896317  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1151  two-component response regulator  25.44 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3228  Two-component protein Kinase  40.85 
 
 		 595 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03368  predicted DNA-binding response regulator in two-component regulatory system  29.92 
 
 		 200 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000358261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0193  transcriptional regulator, LuxR family  29.92 
 
 		 200 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000210245  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3925  transcriptional regulator, LuxR family  29.92 
 
 		 200 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.237516  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03321  hypothetical protein  29.92 
 
 		 200 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00023179  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3824  LuxR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 200 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0991  two component LuxR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0197  two component LuxR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 200 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000437068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.17 
 
 		 208 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3723  LuxR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 200 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0939  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 247 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.224899  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 514 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1115  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.55 
 
 		 225 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0541844  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 201 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4883  transcriptional regulator, LuxR family  29.92 
 
 		 200 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3414  LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 514 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.09 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02400  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  26.2 
 
 		 255 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4008  LuxR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 200 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3471  LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 510 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 232 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.173401  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4050  LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 510 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0475  transcriptional regulator, LuxR family  42.47 
 
 		 123 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4160  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.14 
 
 		 215 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0201669  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 220 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2680  LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 514 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3606  regulatory protein, LuxR  34.12 
 
 		 229 aa  50.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2235  regulatory protein, LuxR  26.07 
 
 		 231 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5154  LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 510 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20460  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.33 
 
 		 229 aa  50.4  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0212792  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0726  response regulator  25.3 
 
 		 211 aa  50.1  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3878  putative transcriptional regulator  45.1 
 
 		 200 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 228 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3813  putative transcriptional regulator  45.1 
 
 		 200 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2145  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.37 
 
 		 220 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196231  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3981  putative transcriptional regulator  45.1 
 
 		 200 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.347336 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1545  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 219 aa  50.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3921  putative transcriptional regulator  45.1 
 
 		 200 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0830  transcriptional regulator  25.3 
 
 		 211 aa  50.1  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3800  putative transcriptional regulator  45.1 
 
 		 200 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0179  LuxR family DNA-binding response regulator  39.62 
 
 		 219 aa  49.7  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  34.09 
 
 		 921 aa  50.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2554  two component LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 219 aa  50.1  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.958854  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 210 aa  50.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 206 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3291  response regulator receiver domain-containing protein  39.44 
 
 		 592 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1627  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 244 aa  49.7  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0484719  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0986  LuxR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 217 aa  49.7  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 221 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 214 aa  49.7  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1093  response regulator  30.34 
 
 		 217 aa  49.7  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.120555  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5778  cyclic nucleotide-binding protein  38.67 
 
 		 353 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.714206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3102  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 		 222 aa  49.7  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.774177  normal  0.15342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 220 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 221 aa  49.3  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>