155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1801 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1801  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 437 aa  893    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1821  MscS mechanosensitive ion channel  73.62 
 
 		 447 aa  627  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.626552  decreased coverage  0.00243652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0018  MscS mechanosensitive ion channel  49.24 
 
 		 416 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3267  MscS Mechanosensitive ion channel  50.25 
 
 		 459 aa  383  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3919  MscS mechanosensitive ion channel  50 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1436  MscS mechanosensitive ion channel  50.13 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3803  MscS mechanosensitive ion channel  51.76 
 
 		 430 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398748 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1574  mechanosensitive ion channel family protein  51.49 
 
 		 436 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332059  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4533  MscS mechanosensitive ion channel  49.36 
 
 		 433 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1377  MscS mechanosensitive ion channel  49.36 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4040  MscS mechanosensitive ion channel  49.36 
 
 		 433 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3828  MscS mechanosensitive ion channel  50.95 
 
 		 433 aa  346  6e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280894  normal  0.277572 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2129  MscS mechanosensitive ion channel  43.45 
 
 		 442 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1659  hypothetical protein  50 
 
 		 442 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19230  hypothetical protein  48.77 
 
 		 442 aa  332  6e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3791  MscS mechanosensitive ion channel  45.92 
 
 		 464 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4577  MscS mechanosensitive ion channel  45.92 
 
 		 413 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5728  MscS mechanosensitive ion channel  45.92 
 
 		 413 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4067  MscS mechanosensitive ion channel  45.15 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1305  MscS mechanosensitive ion channel  48.6 
 
 		 433 aa  329  8e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1267  MscS mechanosensitive ion channel  44.81 
 
 		 416 aa  325  7e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1014  MscS Mechanosensitive ion channel  45.76 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1733  MscS mechanosensitive ion channel  45.11 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1801  hypothetical protein  44.63 
 
 		 444 aa  322  6e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3295  MscS Mechanosensitive ion channel  45.48 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2763  MscS mechanosensitive ion channel  39.69 
 
 		 421 aa  317  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4004  MscS mechanosensitive ion channel  47.12 
 
 		 453 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4466  MscS mechanosensitive ion channel  47.84 
 
 		 413 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0968  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  45.43 
 
 		 403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457255  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2643  hypothetical protein  43.85 
 
 		 412 aa  311  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0621  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  41.62 
 
 		 415 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.841631 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0614  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel  41.36 
 
 		 415 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0670  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  41.36 
 
 		 415 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.74208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0680  small conductance mechanosensitive ion channel family transporter  41.36 
 
 		 415 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1048  MscS mechanosensitive ion channel  44.47 
 
 		 421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.23131 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0736  transporter small conductance mechanosensitive ion channel  41.1 
 
 		 415 aa  302  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0330  MscS Mechanosensitive ion channel  41.85 
 
 		 423 aa  299  6e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.755034 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00538  predicted mechanosensitive channel  41.36 
 
 		 415 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3052  MscS Mechanosensitive ion channel  41.36 
 
 		 415 aa  297  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0624  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  41.36 
 
 		 415 aa  297  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248163  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  41.36 
 
 		 415 aa  297  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.734376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3069  MscS mechanosensitive ion channel  41.36 
 
 		 415 aa  297  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.588458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0658  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  41.36 
 
 		 415 aa  296  4e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0471  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  41.36 
 
 		 415 aa  296  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3752  MscS mechanosensitive ion channel  40.57 
 
 		 416 aa  296  6e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  41.36 
 
 		 415 aa  296  6e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1692  MscS Mechanosensitive ion channel  40.35 
 
 		 403 aa  296  7e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1534  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  44.73 
 
 		 414 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1064  MscS mechanosensitive ion channel  38.4 
 
 		 414 aa  293  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1729  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  44.47 
 
 		 414 aa  293  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.454596  hitchhiker  0.0000587449 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1641  MscS mechanosensitive ion channel  44.47 
 
 		 414 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4834  MscS mechanosensitive ion channel  40.16 
 
 		 421 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0086  MscS mechanosensitive ion channel  38.44 
 
 		 426 aa  287  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.845728  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1640  MscS mechanosensitive ion channel  41.1 
 
 		 406 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.868645  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6004  MscS mechanosensitive ion channel  43.73 
 
 		 417 aa  285  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0634  hypothetical protein  47.12 
 
 		 437 aa  282  8.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4442  MscS mechanosensitive ion channel  38.35 
 
 		 420 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3632  putative small-conductance mechanosensitive channel  40.21 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0118  MscS mechanosensitive ion channel  37.56 
 
 		 422 aa  280  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0327583  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0121  MscS Mechanosensitive ion channel  38.37 
 
 		 421 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0117  MscS mechanosensitive ion channel  37.44 
 
 		 422 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0117  MscS mechanosensitive ion channel  38.37 
 
 		 421 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0122  MscS mechanosensitive ion channel  38.37 
 
 		 421 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4237  MscS mechanosensitive ion channel  38.37 
 
 		 421 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4829  mechanosensitive ion channel  38.01 
 
 		 417 aa  277  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0117  MscS mechanosensitive ion channel  38.36 
 
 		 422 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0112  MscS mechanosensitive ion channel  38.36 
 
 		 422 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.99072 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  35.35 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3951  MscS mechanosensitive ion channel  46.55 
 
 		 422 aa  273  6e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1739  MscS mechanosensitive ion channel  44 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0121  small-conductance mechanosensitive channel  37.05 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0774  MscS Mechanosensitive ion channel  42.12 
 
 		 428 aa  271  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0882  MscS mechanosensitive ion channel  38.22 
 
 		 420 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4158  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 419 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03630  mechanosensitive ion channel  37.68 
 
 		 476 aa  266  5e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0321  MscS mechanosensitive ion channel  43.26 
 
 		 424 aa  258  2e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.870771  normal  0.0509238 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4057  MscS mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 414 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02197  hypothetical protein  36.76 
 
 		 490 aa  254  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10263  putative transmembrane transport protein  46.52 
 
 		 428 aa  253  4.0000000000000004e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.109786  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2323  mechanosensitive ion channel family protein  41.25 
 
 		 406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2846  MscS mechanosensitive ion channel  37.54 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.784545  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6222  MscS Mechanosensitive ion channel  33.42 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1331  MscS mechanosensitive ion channel  33.62 
 
 		 541 aa  145  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.434406  hitchhiker  0.00000000000183262 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  23.48 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  22.08 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  23.48 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  23.48 
 
 		 343 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  23.48 
 
 		 343 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  23.48 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  28.36 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  22.54 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  22.81 
 
 		 381 aa  54.3  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2212  small mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 357 aa  50.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.414294  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  25.95 
 
 		 385 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  20.86 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1914  MscS mechanosensitive ion channel  31.37 
 
 		 275 aa  50.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  21.43 
 
 		 363 aa  50.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  23.76 
 
 		 421 aa  49.7  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  22.51 
 
 		 378 aa  50.1  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>