150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0908 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  100 
 
 		 293 aa  570  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  88.74 
 
 		 293 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  49.34 
 
 		 304 aa  297  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  46.92 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  43.25 
 
 		 295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  44.06 
 
 		 295 aa  238  9e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  43.88 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  41.75 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  37.16 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  35.64 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0851  hypothetical protein  33.22 
 
 		 291 aa  148  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180241  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  35.05 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  33.33 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  32.19 
 
 		 291 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  34.36 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  33.79 
 
 		 296 aa  125  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  29.67 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  33.22 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  29.45 
 
 		 295 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  30.24 
 
 		 294 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  29.76 
 
 		 295 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  29.62 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  25 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  30.42 
 
 		 325 aa  97.1  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  27.31 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  23.64 
 
 		 326 aa  86.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  26.78 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  27.37 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  29.93 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  29.93 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  29.56 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  27.74 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  24.5 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  26.78 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1325  auxin efflux carrier  29.33 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.641195  normal  0.474825 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  25.68 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  27.82 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  26.84 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2903  auxin efflux carrier  30.12 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.788833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  25.69 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  28.79 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  22.3 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  24.45 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  25.41 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  21.95 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  29.19 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0121  auxin efflux carrier  28.5 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  29.72 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  25.24 
 
 		 311 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  23.4 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  26.83 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  24.5 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  25 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  28.04 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  31.82 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  28.66 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  23.71 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0742  Auxin Efflux Carrier  25.8 
 
 		 328 aa  53.1  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.678682 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  27.31 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  23.85 
 
 		 310 aa  52.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  21.97 
 
 		 313 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  34.82 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  24.59 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  22.32 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  24.88 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  23.15 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  23.74 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  26.05 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  29.46 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  26.26 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  29.46 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  19.02 
 
 		 320 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  23.41 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  22.19 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 313 aa  50.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1052  auxin efflux carrier  21.9 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.951846  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  24.14 
 
 		 305 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  23.15 
 
 		 305 aa  49.7  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  23.28 
 
 		 313 aa  49.7  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  26.11 
 
 		 311 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  23.23 
 
 		 305 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  23.23 
 
 		 305 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  24.62 
 
 		 313 aa  48.9  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  29 
 
 		 307 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  24 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  29.05 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  21.49 
 
 		 361 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  22.12 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  28.06 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  22.11 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  23.23 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  23.79 
 
 		 304 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  23.9 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  23.23 
 
 		 305 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  22.32 
 
 		 307 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  25.59 
 
 		 311 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>