94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1357 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  100 
 
 
235 aa  479  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  74.55 
 
 
238 aa  337  9e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  37.84 
 
 
298 aa  85.5  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  36.55 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  33.33 
 
 
350 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1727  sortase family protein  32.37 
 
 
288 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  36.72 
 
 
244 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  27.48 
 
 
324 aa  61.2  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5062  sortase family protein  31.2 
 
 
241 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000275463  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  31.17 
 
 
321 aa  58.5  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  30.07 
 
 
339 aa  58.2  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  34.97 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  32.31 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  33.33 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1003  sortase family protein  35.38 
 
 
301 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  31.36 
 
 
556 aa  55.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  34.11 
 
 
238 aa  55.8  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  31.09 
 
 
354 aa  55.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  34.93 
 
 
251 aa  55.1  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  33.33 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  23.11 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  32.61 
 
 
521 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0124  sortase family protein  33.59 
 
 
292 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145453  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  30.67 
 
 
365 aa  53.5  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  35.25 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  31.03 
 
 
251 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  34.21 
 
 
218 aa  52.4  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  34.03 
 
 
309 aa  52  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  33.33 
 
 
188 aa  52  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  27.19 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1025  sortase family protein  32.54 
 
 
337 aa  51.6  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  33.33 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  27.91 
 
 
187 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1533  sortase (surface protein transpeptidase)  28.35 
 
 
395 aa  50.8  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.223047  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  27.91 
 
 
187 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0136  peptidase C60 sortase A and B  28 
 
 
308 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.765085  hitchhiker  0.000446536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  30.6 
 
 
214 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  28.85 
 
 
262 aa  49.7  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  27.61 
 
 
192 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  31.75 
 
 
178 aa  48.9  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  32.8 
 
 
316 aa  48.5  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  30.37 
 
 
302 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  34.82 
 
 
291 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  31.03 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  28.65 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  34.07 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  31.31 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1804  sortase family protein  31.19 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  28.8 
 
 
381 aa  47.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  28.46 
 
 
206 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  29.73 
 
 
234 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  25.45 
 
 
412 aa  46.6  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  24.06 
 
 
233 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  30.91 
 
 
336 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  29.41 
 
 
223 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  29.63 
 
 
249 aa  46.6  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  32.14 
 
 
377 aa  46.2  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  30.16 
 
 
298 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  30.37 
 
 
298 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  30.37 
 
 
323 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  28.41 
 
 
192 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  28.3 
 
 
209 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  29.29 
 
 
235 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  21.95 
 
 
250 aa  45.4  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  25.4 
 
 
225 aa  45.4  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  26.67 
 
 
187 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  30 
 
 
368 aa  45.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  26.32 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  33.71 
 
 
377 aa  44.7  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  31.19 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  34.55 
 
 
384 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  28.32 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  27.07 
 
 
260 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  25.98 
 
 
327 aa  44.7  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.69 
 
 
206 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.92 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  34.09 
 
 
270 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  30.72 
 
 
279 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  30.28 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  30.69 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  32.1 
 
 
298 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.69 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.92 
 
 
206 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  33.57 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2937  peptidase C60, sortase A and B  35.87 
 
 
195 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  28.67 
 
 
226 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.2 
 
 
210 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  27.78 
 
 
206 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.2 
 
 
210 aa  42  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  30.77 
 
 
228 aa  42  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  27.81 
 
 
210 aa  42  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  26.04 
 
 
238 aa  41.6  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  28.1 
 
 
245 aa  41.6  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  29.11 
 
 
243 aa  41.6  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>