61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0162 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  100 
 
 		 420 aa  855    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  48.74 
 
 		 356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  48.25 
 
 		 347 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  48.43 
 
 		 356 aa  323  2e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  49.36 
 
 		 333 aa  318  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  50.8 
 
 		 376 aa  317  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  47.53 
 
 		 363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  45.72 
 
 		 349 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  44.34 
 
 		 349 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1066  cellulase  48.55 
 
 		 709 aa  290  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  42.79 
 
 		 635 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  42.21 
 
 		 336 aa  271  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01285  Endo-beta-1,4-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDU5]  45.11 
 
 		 326 aa  269  7e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05214  Endo-beta-1,4-glucanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS8]  42.49 
 
 		 334 aa  249  9e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  42.21 
 
 		 340 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  41.64 
 
 		 556 aa  227  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2344  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1155  glycoside hydrolase family 5  28.2 
 
 		 749 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.675797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4460  glycoside hydrolase family protein  27.43 
 
 		 814 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3417  twin-arginine translocation pathway signal  27.44 
 
 		 831 aa  97.1  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2924  glycoside hydrolase family protein  26.45 
 
 		 461 aa  76.3  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  54.39 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4600  glycoside hydrolase family protein  22.58 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  23.55 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  24.07 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  26.78 
 
 		 584 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  30.05 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  25.99 
 
 		 468 aa  57.4  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  25.21 
 
 		 566 aa  57  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0079  glycoside hydrolase family 5  27.08 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.265461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  23.98 
 
 		 1414 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  23.79 
 
 		 814 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  24.89 
 
 		 1294 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0736  glycoside hydrolase family 5  25 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  hitchhiker  0.000337788 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  23.64 
 
 		 1194 aa  55.1  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  24.66 
 
 		 1369 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0723  glycoside hydrolase family protein  33.62 
 
 		 362 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  27.59 
 
 		 525 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  25 
 
 		 900 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  23.58 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  19.17 
 
 		 335 aa  51.6  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  26.43 
 
 		 501 aa  50.8  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  23.4 
 
 		 445 aa  49.7  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  24.29 
 
 		 869 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  23.6 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  26.03 
 
 		 523 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2228  glycoside hydrolase family 5  25.12 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  25.98 
 
 		 562 aa  47  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  25.27 
 
 		 621 aa  46.6  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  21 
 
 		 335 aa  46.6  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  22.11 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  26.61 
 
 		 717 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3292  type III effector HopAH2-1  25 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.622578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  23.83 
 
 		 608 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1378  hypothetical protein  43.1 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  26.25 
 
 		 533 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  28.85 
 
 		 755 aa  44.3  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  22.52 
 
 		 543 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1713  glycoside hydrolase family protein  25.77 
 
 		 472 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3739  hypothetical protein  44.23 
 
 		 128 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389983  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  20.9 
 
 		 470 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>