More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2292 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  100 
 
 		 207 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  71.36 
 
 		 235 aa  307  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3791  electron transport protein SCO1/SenC  51.23 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  43.59 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  43.23 
 
 		 193 aa  138  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  38.25 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  36.42 
 
 		 216 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  34.94 
 
 		 425 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  33.16 
 
 		 218 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  34.2 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  33.16 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  35.76 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  29.9 
 
 		 363 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  31.41 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  32.24 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1255  hypothetical protein  35.06 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.847765  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  40.82 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  36.97 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  30.87 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0714  hypothetical protein  36.89 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  39.06 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2235  hypothetical protein  36.89 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2319  hypothetical protein  36.89 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  34.45 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  30.65 
 
 		 221 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  29.94 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  29.94 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  32.28 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  28.89 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  40.66 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  40.66 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  32.28 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  40.66 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  31.15 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  33.04 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1711  hypothetical protein  40.66 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  34.07 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  34.07 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  30.11 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  28.37 
 
 		 356 aa  68.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  38.39 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  31.19 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  39.78 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  42.53 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  36.36 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  32.17 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  36.67 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  35.42 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  31.5 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  30.16 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1986  electron transport protein SCO1/SenC  34.09 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  28.7 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  23.53 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  40.21 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  30.67 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  35.85 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  28.79 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  39.02 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  30.95 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  42.22 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  28.92 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  30.16 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  41.77 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  36.36 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  36.19 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  39.29 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  41.86 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  28.91 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  38.55 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2329  hypothetical protein  35.64 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  29.25 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 221 aa  62  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  30.43 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  34.9 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  40.32 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  31.25 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0582  electron transport protein SCO1/SenC  33.63 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  44.26 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  43.55 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1948  electron transport protein SCO1/SenC  32.74 
 
 		 248 aa  61.2  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  30.25 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  32.56 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  33 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  36.05 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  34.23 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  36.73 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  37.35 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  36.73 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  32.46 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
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NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  36.73 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  34.09 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
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