245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1863 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 329 aa  666    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  82.87 
 
 		 331 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  82.5 
 
 		 331 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  79.03 
 
 		 316 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  60.25 
 
 		 337 aa  378  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3517  aminoglycoside phosphotransferase  55.76 
 
 		 334 aa  321  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2913  aminoglycoside phosphotransferase  49.22 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.605881  normal  0.0304684 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  44.37 
 
 		 447 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2483  aminoglycoside phosphotransferase  47.9 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3968  aminoglycoside phosphotransferase  45.37 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574254  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4584  aminoglycoside phosphotransferase  41.43 
 
 		 475 aa  199  7e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1585  aminoglycoside phosphotransferase  38.26 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1609  aminoglycoside phosphotransferase  38.26 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1555  aminoglycoside phosphotransferase  37.94 
 
 		 319 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.346641 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5527  putative aminoglycoside phosphotransferase  38.89 
 
 		 311 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 		 443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4469  aminoglycoside phosphotransferase  37.69 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00940393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4452  aminoglycoside phosphotransferase  34.15 
 
 		 346 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.744873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2791  aminoglycoside phosphotransferase  35.58 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1891  aminoglycoside phosphotransferase  34.46 
 
 		 350 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35990  FadE36, aminoglycoside phosphotransferase  34.5 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139022  hitchhiker  0.0000000000000200155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  30.45 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  28.38 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  30.45 
 
 		 346 aa  109  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2501  aminoglycoside phosphotransferase  30.1 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113216 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  25.15 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  29.21 
 
 		 403 aa  96.7  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  26.28 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  29.32 
 
 		 429 aa  94  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  29.28 
 
 		 358 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  32 
 
 		 357 aa  93.2  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  31.38 
 
 		 315 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  27.07 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  29.1 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  30.83 
 
 		 337 aa  90.1  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  26.48 
 
 		 370 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  31.54 
 
 		 355 aa  87.4  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1505  aminoglycoside phosphotransferase  30.71 
 
 		 358 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1528  aminoglycoside phosphotransferase  30.71 
 
 		 358 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  28.25 
 
 		 347 aa  86.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  30.67 
 
 		 379 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  27.58 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  26.97 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0894  aminoglycoside phosphotransferase  34.12 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  28.89 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  24.85 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1505  aminoglycoside phosphotransferase  29.83 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  25.83 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  26.36 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  28.12 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  29.02 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  26.73 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  25.95 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  26.01 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  29.72 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  27.22 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  28.33 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  30.1 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2683  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  29.48 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.124499  normal  0.283498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  26.75 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  28.63 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  26.62 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  28.97 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  28.48 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  27.39 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  26.77 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  30.03 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  26.62 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  25.94 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  27.39 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2010  aminoglycoside phosphotransferase  28 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0773583  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  27.8 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  25.69 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  23.34 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  27.19 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  26.32 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2027  aminoglycoside phosphotransferase  28 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2073  aminoglycoside phosphotransferase  28 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  27.4 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  26.51 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  26.28 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  24.69 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  25.63 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  28.99 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  29.29 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7694  aminoglycoside phosphotransferase  28.75 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  24.28 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  26.2 
 
 		 355 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  25.15 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  29.29 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  26.65 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  23.95 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  28.33 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  26.54 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  26.63 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  29.34 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  25.84 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>