245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1459 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 354 aa  738    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  53.67 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  53.43 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  52.97 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  52.54 
 
 		 355 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  52.26 
 
 		 355 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  52.26 
 
 		 355 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  51.41 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  51.41 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  50.7 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  50.99 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  51.84 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  48.45 
 
 		 429 aa  342  5e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 		 348 aa  337  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  48 
 
 		 361 aa  333  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  46.39 
 
 		 403 aa  332  6e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  46.89 
 
 		 348 aa  332  7.000000000000001e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  52.17 
 
 		 379 aa  331  9e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  47.06 
 
 		 363 aa  327  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  48.17 
 
 		 355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  48.96 
 
 		 354 aa  310  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  43.82 
 
 		 380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  43.82 
 
 		 370 aa  306  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  49.22 
 
 		 357 aa  306  4.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  45.27 
 
 		 344 aa  305  6e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2515  phosphotransferase enzyme family protein  48.55 
 
 		 358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2653  phosphotransferase enzyme family protein  48.55 
 
 		 358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0946  phosphotransferase enzyme family protein  48.55 
 
 		 876 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0521  phosphotransferase enzyme family protein  47.98 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828343  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1623  phosphotransferase enzyme family protein  48.7 
 
 		 358 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0243  phosphotransferase enzyme family protein  48.7 
 
 		 358 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0279  phosphotransferase enzyme family protein  48.7 
 
 		 358 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.438432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1426  phosphotransferase enzyme family protein  48.7 
 
 		 358 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  44.83 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  42.66 
 
 		 362 aa  282  5.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  41.86 
 
 		 351 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  41.11 
 
 		 352 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  41.64 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  40.18 
 
 		 350 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  36.05 
 
 		 349 aa  225  8e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  37.35 
 
 		 338 aa  215  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  36.8 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  40.27 
 
 		 344 aa  212  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  36.23 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  36.02 
 
 		 358 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  37.38 
 
 		 356 aa  202  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  36.36 
 
 		 354 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  35.01 
 
 		 339 aa  199  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  34.76 
 
 		 347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  34.58 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  36.59 
 
 		 315 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  36.31 
 
 		 344 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  37.26 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  34.81 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  36.7 
 
 		 341 aa  192  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  33.24 
 
 		 356 aa  192  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  36.94 
 
 		 346 aa  192  8e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  34.39 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.09 
 
 		 815 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  36.16 
 
 		 350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  33.24 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1653  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 		 377 aa  186  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.793508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  34.48 
 
 		 353 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  34.78 
 
 		 344 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  32.96 
 
 		 365 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  32.58 
 
 		 359 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  36.11 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  32.59 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  34.27 
 
 		 344 aa  180  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  33.52 
 
 		 364 aa  179  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  32.59 
 
 		 338 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  32.59 
 
 		 338 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  32.59 
 
 		 338 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  31.2 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  32.65 
 
 		 344 aa  176  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 353 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  32.54 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2361  phosphotransferase enzyme family protein, putative  33.79 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.699195  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  33.44 
 
 		 337 aa  172  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  32.9 
 
 		 451 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  32.49 
 
 		 339 aa  169  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  34.34 
 
 		 352 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1885  aminoglycoside phosphotransferase  30.38 
 
 		 354 aa  169  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  31 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  35.05 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  33.91 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  34.01 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  30.6 
 
 		 347 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  32.41 
 
 		 358 aa  165  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  35.38 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  33.02 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1204  aminoglycoside phosphotransferase  32.19 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  34.21 
 
 		 358 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  34.05 
 
 		 345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  31.78 
 
 		 352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  31.63 
 
 		 391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  31.13 
 
 		 351 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  33.54 
 
 		 360 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  34.26 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>