224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0471 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
403 aa  843    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  68.26 
 
 
429 aa  588  1e-167  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  55.56 
 
 
370 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  54.28 
 
 
380 aa  425  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  57.43 
 
 
355 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  56.21 
 
 
357 aa  401  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  52.44 
 
 
354 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  53.33 
 
 
379 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  49.15 
 
 
355 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  48.58 
 
 
355 aa  368  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  47.73 
 
 
355 aa  362  4e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  49.29 
 
 
356 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  51.44 
 
 
354 aa  360  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  46.88 
 
 
355 aa  359  6e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  48.73 
 
 
356 aa  359  6e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  47.73 
 
 
355 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  46.59 
 
 
355 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  47.16 
 
 
355 aa  348  8e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  46.88 
 
 
355 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0946  phosphotransferase enzyme family protein  49.06 
 
 
876 aa  340  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2515  phosphotransferase enzyme family protein  50.57 
 
 
358 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0521  phosphotransferase enzyme family protein  49.3 
 
 
358 aa  338  8e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828343  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2653  phosphotransferase enzyme family protein  50.57 
 
 
358 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0243  phosphotransferase enzyme family protein  50.29 
 
 
358 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0279  phosphotransferase enzyme family protein  50.29 
 
 
358 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.438432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1426  phosphotransferase enzyme family protein  50.29 
 
 
358 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1623  phosphotransferase enzyme family protein  50.29 
 
 
358 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  46.39 
 
 
354 aa  332  8e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  44 
 
 
348 aa  296  5e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  43.61 
 
 
348 aa  289  6e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  42.69 
 
 
361 aa  286  7e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  42.2 
 
 
363 aa  275  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  39.94 
 
 
353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  37.32 
 
 
351 aa  248  9e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  36.7 
 
 
350 aa  243  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  36.73 
 
 
352 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  38.74 
 
 
344 aa  239  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  37.72 
 
 
357 aa  228  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  36.68 
 
 
362 aa  218  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  36.78 
 
 
358 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  34.08 
 
 
353 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  33.43 
 
 
353 aa  202  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.41 
 
 
815 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  32.92 
 
 
355 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  37.67 
 
 
344 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  35.99 
 
 
344 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  34.27 
 
 
338 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  36.83 
 
 
358 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  35.76 
 
 
346 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  35.76 
 
 
346 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  35.48 
 
 
353 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  34.12 
 
 
349 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  35.6 
 
 
352 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  35.02 
 
 
339 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  33.86 
 
 
341 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  33.43 
 
 
354 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  36.89 
 
 
358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  34.07 
 
 
359 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  33.43 
 
 
315 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  34.29 
 
 
388 aa  170  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 
356 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  32.8 
 
 
354 aa  170  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  32.37 
 
 
344 aa  170  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  33.02 
 
 
356 aa  169  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
353 aa  168  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  30.87 
 
 
349 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  35.99 
 
 
359 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  33.52 
 
 
351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  31.78 
 
 
347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1204  aminoglycoside phosphotransferase  35.11 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  31.7 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  34.49 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  35.45 
 
 
353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  32.54 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  33.75 
 
 
364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  34.49 
 
 
391 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  32.62 
 
 
361 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  31.61 
 
 
451 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  30.47 
 
 
358 aa  162  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 
361 aa  162  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  35.46 
 
 
348 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  33.74 
 
 
363 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1653  aminoglycoside phosphotransferase  28.2 
 
 
377 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.793508  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  30.52 
 
 
344 aa  160  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  32.3 
 
 
345 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  32.83 
 
 
361 aa  160  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  32.84 
 
 
368 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  32.83 
 
 
362 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1885  aminoglycoside phosphotransferase  31.12 
 
 
354 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  32.83 
 
 
362 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  34.29 
 
 
352 aa  159  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  32.57 
 
 
337 aa  159  9e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2361  phosphotransferase enzyme family protein, putative  31.23 
 
 
322 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.699195  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  32.82 
 
 
358 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  33.44 
 
 
358 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  32.81 
 
 
360 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  33.85 
 
 
368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  35.11 
 
 
353 aa  156  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  32.06 
 
 
342 aa  156  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  32.52 
 
 
361 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>