243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3072 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
388 aa  803    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  80.45 
 
 
358 aa  587  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  59.94 
 
 
359 aa  439  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  59.88 
 
 
348 aa  428  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  58.5 
 
 
352 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  57.62 
 
 
391 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  57.64 
 
 
352 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  57.06 
 
 
352 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  56.77 
 
 
353 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  56.06 
 
 
364 aa  411  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  59.03 
 
 
352 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  53.41 
 
 
354 aa  388  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  52.97 
 
 
362 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  52.97 
 
 
362 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  52.09 
 
 
358 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  53.58 
 
 
368 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  53.58 
 
 
368 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  52.57 
 
 
368 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  50.57 
 
 
358 aa  359  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  50.57 
 
 
358 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  52.56 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  52.56 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  52.56 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  52.56 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  52.56 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  52.56 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  50.28 
 
 
361 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  52.27 
 
 
368 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  51.7 
 
 
368 aa  353  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  49.55 
 
 
344 aa  348  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  48.6 
 
 
361 aa  346  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  52.82 
 
 
355 aa  344  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  50.84 
 
 
361 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  50.84 
 
 
361 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  51.6 
 
 
353 aa  342  7e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  48.9 
 
 
368 aa  342  8e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  51.83 
 
 
343 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  50.29 
 
 
353 aa  339  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  49.58 
 
 
362 aa  338  7e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  50.29 
 
 
353 aa  338  9e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  51.79 
 
 
343 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  52.13 
 
 
343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  50.91 
 
 
342 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  52.13 
 
 
343 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  52.13 
 
 
343 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  48.03 
 
 
361 aa  336  5e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 
343 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  47.65 
 
 
363 aa  333  4e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  50.6 
 
 
357 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  50.42 
 
 
363 aa  330  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 
344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  48.6 
 
 
363 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  49.85 
 
 
343 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  48.18 
 
 
345 aa  324  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  50.96 
 
 
343 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  44.35 
 
 
356 aa  309  5.9999999999999995e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  45.56 
 
 
352 aa  301  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  47.62 
 
 
346 aa  299  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  44.58 
 
 
354 aa  299  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  47.62 
 
 
346 aa  298  9e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  43.71 
 
 
353 aa  297  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  44.9 
 
 
337 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  44.82 
 
 
336 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  46.64 
 
 
339 aa  278  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  42.61 
 
 
344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  43.21 
 
 
358 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  44.92 
 
 
344 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  40.48 
 
 
358 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  38.27 
 
 
338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  38.46 
 
 
339 aa  219  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  40.12 
 
 
341 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  34.1 
 
 
364 aa  207  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  38.41 
 
 
338 aa  207  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  35.69 
 
 
382 aa  205  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  39.69 
 
 
359 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  38.51 
 
 
348 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  38.33 
 
 
356 aa  203  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 
353 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  37.94 
 
 
344 aa  203  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  39.46 
 
 
337 aa  202  9e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  36.47 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  39.3 
 
 
354 aa  199  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  38.23 
 
 
315 aa  199  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  36.23 
 
 
344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  34.08 
 
 
401 aa  196  5.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  34.4 
 
 
354 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  35.19 
 
 
348 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  36.44 
 
 
351 aa  192  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  36.36 
 
 
347 aa  190  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  37.58 
 
 
355 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  37.24 
 
 
355 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 
355 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 
355 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  35.28 
 
 
356 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  35.28 
 
 
356 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  39.75 
 
 
357 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  36.34 
 
 
355 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  40.25 
 
 
339 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  34.23 
 
 
338 aa  182  9.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  36.31 
 
 
355 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>