235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0994 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
358 aa  741    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  80.45 
 
 
388 aa  587  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  59.05 
 
 
359 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  60.23 
 
 
391 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  59.94 
 
 
352 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  58.13 
 
 
364 aa  431  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  59.37 
 
 
352 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  58.79 
 
 
353 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  59.08 
 
 
352 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  57.39 
 
 
354 aa  414  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  58.29 
 
 
348 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  53.59 
 
 
362 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  53.31 
 
 
362 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  57.79 
 
 
352 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  53.41 
 
 
358 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  55.17 
 
 
368 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  55.17 
 
 
368 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  54.57 
 
 
368 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  53.46 
 
 
361 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  54.96 
 
 
368 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  51.85 
 
 
358 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  54.96 
 
 
368 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  54.96 
 
 
368 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  54.67 
 
 
368 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  54.67 
 
 
368 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  54.96 
 
 
368 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  54.96 
 
 
368 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  54.96 
 
 
368 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  51.27 
 
 
358 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  52.81 
 
 
361 aa  378  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  55.98 
 
 
355 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  52.74 
 
 
353 aa  362  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  51.25 
 
 
368 aa  362  7.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  50.14 
 
 
361 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  52.96 
 
 
361 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  51.87 
 
 
353 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  52.68 
 
 
361 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  52.12 
 
 
345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  51.9 
 
 
353 aa  352  7e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  48.96 
 
 
344 aa  349  5e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  50.42 
 
 
362 aa  348  7e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  51.55 
 
 
363 aa  346  4e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  49.73 
 
 
363 aa  345  5e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  53.03 
 
 
343 aa  344  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  53.75 
 
 
343 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  53.75 
 
 
343 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  53.75 
 
 
343 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  50.14 
 
 
363 aa  342  5.999999999999999e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  53.19 
 
 
343 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  52.28 
 
 
357 aa  338  9e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  51.37 
 
 
343 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  51.22 
 
 
342 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  51.2 
 
 
343 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  50.3 
 
 
343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  47.41 
 
 
356 aa  322  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  47.02 
 
 
344 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  48.9 
 
 
354 aa  317  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  47.93 
 
 
352 aa  316  5e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  45.48 
 
 
353 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  49.68 
 
 
346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  49.68 
 
 
346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  46.15 
 
 
337 aa  298  9e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  48.33 
 
 
344 aa  294  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  47.42 
 
 
336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  48.8 
 
 
344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  46.98 
 
 
339 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  44.3 
 
 
358 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  43.25 
 
 
358 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  36.89 
 
 
338 aa  220  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  39.74 
 
 
339 aa  219  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  40.45 
 
 
348 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  41.47 
 
 
337 aa  215  8e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  38.33 
 
 
382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  39.88 
 
 
344 aa  212  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  40.26 
 
 
344 aa  212  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  39.48 
 
 
338 aa  210  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  39.64 
 
 
341 aa  209  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  36.69 
 
 
364 aa  209  8e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  38.66 
 
 
349 aa  208  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  36.15 
 
 
355 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  35.99 
 
 
401 aa  206  4e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  36.63 
 
 
355 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  36.92 
 
 
355 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  36.73 
 
 
355 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  40.31 
 
 
359 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  35.59 
 
 
354 aa  203  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  35.48 
 
 
355 aa  202  9e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  36.11 
 
 
348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  35.76 
 
 
356 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  35.76 
 
 
356 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  34.88 
 
 
355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  41.28 
 
 
353 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  38.8 
 
 
354 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  37.92 
 
 
356 aa  196  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  34.97 
 
 
355 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  37.01 
 
 
358 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  36.23 
 
 
344 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  35.21 
 
 
353 aa  194  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  37.27 
 
 
347 aa  192  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  34.88 
 
 
355 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>