234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2960 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
363 aa  753    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  88.4 
 
 
363 aa  657    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  79.78 
 
 
361 aa  619  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  80.17 
 
 
361 aa  601  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  75.62 
 
 
368 aa  593  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  75.9 
 
 
361 aa  584  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  78.83 
 
 
362 aa  578  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  74.79 
 
 
361 aa  565  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  75.07 
 
 
361 aa  564  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  71.75 
 
 
363 aa  525  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  67.5 
 
 
362 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  67.5 
 
 
362 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  68.06 
 
 
358 aa  512  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  68.82 
 
 
368 aa  511  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  67.5 
 
 
358 aa  511  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  66.02 
 
 
358 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  67.98 
 
 
368 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  66.39 
 
 
368 aa  494  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  65.37 
 
 
368 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  65.37 
 
 
368 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  65.37 
 
 
368 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  65.1 
 
 
368 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  65.37 
 
 
368 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  65.37 
 
 
368 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  65.37 
 
 
368 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  64.27 
 
 
368 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  54.62 
 
 
354 aa  399  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  55.68 
 
 
364 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  55.96 
 
 
355 aa  378  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  55.97 
 
 
353 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  54.97 
 
 
346 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  54.39 
 
 
346 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  52.6 
 
 
345 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  54.24 
 
 
359 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  51.82 
 
 
352 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  54.08 
 
 
344 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  50.56 
 
 
352 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  50.7 
 
 
352 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  51.55 
 
 
358 aa  356  3.9999999999999996e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  51.26 
 
 
353 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  52.98 
 
 
337 aa  354  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  51.12 
 
 
353 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  51.4 
 
 
353 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  50.42 
 
 
391 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  51.74 
 
 
352 aa  350  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  51.04 
 
 
354 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  49.12 
 
 
344 aa  341  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  50.85 
 
 
388 aa  339  4e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  52.21 
 
 
343 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  52.21 
 
 
357 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  51.62 
 
 
343 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  51.62 
 
 
343 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  51.62 
 
 
343 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  51.03 
 
 
343 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  50.29 
 
 
348 aa  328  6e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  50.3 
 
 
343 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  48.02 
 
 
356 aa  323  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  50.15 
 
 
343 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  48.4 
 
 
344 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  50.62 
 
 
344 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  50.45 
 
 
342 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  50.3 
 
 
353 aa  317  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  48.6 
 
 
352 aa  308  9e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  46.67 
 
 
358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  48.75 
 
 
339 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  46.69 
 
 
343 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  48.44 
 
 
336 aa  295  9e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  42.72 
 
 
358 aa  266  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  46.64 
 
 
337 aa  236  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  39.63 
 
 
401 aa  226  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  37.25 
 
 
364 aa  226  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0403488 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  36.41 
 
 
382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  37.61 
 
 
338 aa  202  7e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  40.78 
 
 
353 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  39.76 
 
 
339 aa  196  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  41.98 
 
 
264 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  38.05 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  33.63 
 
 
349 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  37.8 
 
 
354 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  36.84 
 
 
344 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  34.95 
 
 
359 aa  180  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  34.69 
 
 
348 aa  179  9e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  33.24 
 
 
355 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  37.35 
 
 
341 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  36.53 
 
 
344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33361  protein serine/threonine kinase activity  32.95 
 
 
408 aa  173  3.9999999999999995e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 
357 aa  172  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  33.43 
 
 
355 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02490  conserved hypothetical protein  32.98 
 
 
428 aa  171  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  38.63 
 
 
315 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  33.7 
 
 
356 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  37.15 
 
 
356 aa  170  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  33.7 
 
 
356 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  31.62 
 
 
355 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  33.63 
 
 
348 aa  169  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  34.48 
 
 
351 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  32.92 
 
 
339 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  31.62 
 
 
355 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  36.75 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  36.75 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>