242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5104 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  100 
 
 		 352 aa  730    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  81.66 
 
 		 352 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  81.03 
 
 		 391 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  77.27 
 
 		 353 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  76.22 
 
 		 352 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  65.13 
 
 		 359 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  58.95 
 
 		 364 aa  444  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  61.89 
 
 		 352 aa  431  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  60 
 
 		 354 aa  434  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  59.08 
 
 		 358 aa  420  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  58.97 
 
 		 362 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  58.97 
 
 		 362 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  57.06 
 
 		 388 aa  412  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  58.17 
 
 		 368 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  57.51 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  57.59 
 
 		 368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  57.71 
 
 		 358 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  56.16 
 
 		 358 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  55.4 
 
 		 358 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  56.13 
 
 		 368 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  56.13 
 
 		 368 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  54.9 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  56.53 
 
 		 368 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  56.13 
 
 		 368 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  55.84 
 
 		 368 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  55.84 
 
 		 368 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  56.13 
 
 		 368 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  56.13 
 
 		 368 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  55.62 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  56.45 
 
 		 353 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  55.17 
 
 		 368 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  56.16 
 
 		 353 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  52.94 
 
 		 361 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  53.46 
 
 		 368 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  54.06 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  54.34 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  58.81 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  54.13 
 
 		 353 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  52.38 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  51.67 
 
 		 363 aa  358  8e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  51.82 
 
 		 363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  50.42 
 
 		 363 aa  348  7e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  48.04 
 
 		 344 aa  333  4e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  49.09 
 
 		 345 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  47.62 
 
 		 356 aa  329  5.0000000000000004e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  49.1 
 
 		 354 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  49.85 
 
 		 342 aa  322  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  49.84 
 
 		 343 aa  322  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  49.07 
 
 		 343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  49.53 
 
 		 343 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  49.53 
 
 		 343 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  49.53 
 
 		 343 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  49.52 
 
 		 357 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  49.52 
 
 		 343 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  48.89 
 
 		 346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  48.26 
 
 		 343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  47.31 
 
 		 353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  48.57 
 
 		 346 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  48.9 
 
 		 343 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  46.02 
 
 		 344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  47.3 
 
 		 337 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  47.02 
 
 		 352 aa  301  8.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  45.32 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  44.84 
 
 		 344 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  47.81 
 
 		 339 aa  279  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  44.65 
 
 		 358 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  44.31 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  43.53 
 
 		 358 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  39.03 
 
 		 364 aa  242  7e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0403488 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  39.78 
 
 		 382 aa  230  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  43.9 
 
 		 353 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  44.19 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  41.64 
 
 		 339 aa  222  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  40.67 
 
 		 349 aa  222  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  39.58 
 
 		 355 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  34.22 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  39.27 
 
 		 355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  41.72 
 
 		 344 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  38.07 
 
 		 355 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  38.67 
 
 		 355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  41.34 
 
 		 354 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  41.64 
 
 		 356 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  36.45 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  39.42 
 
 		 344 aa  210  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  40.74 
 
 		 341 aa  209  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  37.76 
 
 		 355 aa  208  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  39.23 
 
 		 338 aa  204  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  36.73 
 
 		 350 aa  202  6e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  37.65 
 
 		 356 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  39.94 
 
 		 359 aa  202  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  39.22 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  38.27 
 
 		 356 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  35.95 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  39.13 
 
 		 315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  38.17 
 
 		 355 aa  199  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  34.59 
 
 		 348 aa  199  9e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  41.19 
 
 		 338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  41.19 
 
 		 338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  41.19 
 
 		 338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  35.96 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>