229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3925 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  92.11 
 
 		 355 aa  692    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 355 aa  742    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  95.21 
 
 		 355 aa  708    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  98.59 
 
 		 355 aa  733    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  80.28 
 
 		 355 aa  619  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  80.85 
 
 		 355 aa  618  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  79.21 
 
 		 356 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  79.49 
 
 		 356 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  78.03 
 
 		 355 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  77.46 
 
 		 355 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  58.59 
 
 		 354 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  52.54 
 
 		 354 aa  393  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  50.97 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  52.87 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  49.71 
 
 		 370 aa  362  6e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  48.17 
 
 		 357 aa  352  5.9999999999999994e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  47.16 
 
 		 403 aa  348  7e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0521  phosphotransferase enzyme family protein  50.57 
 
 		 358 aa  347  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  45.81 
 
 		 361 aa  346  4e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  48.2 
 
 		 380 aa  345  7e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  49.7 
 
 		 348 aa  343  2e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2515  phosphotransferase enzyme family protein  49.43 
 
 		 358 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2653  phosphotransferase enzyme family protein  49.43 
 
 		 358 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0946  phosphotransferase enzyme family protein  49.43 
 
 		 876 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0243  phosphotransferase enzyme family protein  49.14 
 
 		 358 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0279  phosphotransferase enzyme family protein  49.14 
 
 		 358 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.438432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1426  phosphotransferase enzyme family protein  49.14 
 
 		 358 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1623  phosphotransferase enzyme family protein  49.14 
 
 		 358 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  50.46 
 
 		 379 aa  333  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  48.34 
 
 		 354 aa  331  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  45.61 
 
 		 348 aa  330  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  43.15 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  42.9 
 
 		 344 aa  295  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  43.1 
 
 		 353 aa  294  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  42.69 
 
 		 362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  38.78 
 
 		 351 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  38.81 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  38.91 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  41.03 
 
 		 357 aa  250  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  39.45 
 
 		 358 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  39.58 
 
 		 338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.45 
 
 		 815 aa  222  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  38.07 
 
 		 352 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  36.93 
 
 		 354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  36.94 
 
 		 359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  39.09 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  36.11 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  36.92 
 
 		 358 aa  204  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  37.38 
 
 		 349 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  39 
 
 		 344 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  36.71 
 
 		 365 aa  203  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  39.12 
 
 		 359 aa  202  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  37.24 
 
 		 451 aa  202  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  37.31 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  35.48 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  36.31 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  37.01 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  37.46 
 
 		 391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  35.1 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  33.85 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  33.9 
 
 		 352 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  34.69 
 
 		 364 aa  195  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  34.11 
 
 		 345 aa  195  9e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  32.62 
 
 		 355 aa  194  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  34.81 
 
 		 347 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  33.53 
 
 		 344 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  37.3 
 
 		 338 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  34.86 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1653  aminoglycoside phosphotransferase  33.85 
 
 		 377 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.793508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  35.4 
 
 		 354 aa  193  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  35.67 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  37.63 
 
 		 353 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  37.15 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  31.82 
 
 		 356 aa  190  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  34.6 
 
 		 343 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  32.55 
 
 		 344 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  32.02 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  35.22 
 
 		 362 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  35.22 
 
 		 362 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  34.29 
 
 		 357 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  34.02 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  34.02 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  34.02 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  33.92 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  35.83 
 
 		 362 aa  183  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  34.55 
 
 		 344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  33.92 
 
 		 343 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  32.56 
 
 		 358 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  33.73 
 
 		 342 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  34.28 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  32.28 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  33.94 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  34.04 
 
 		 353 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  35.42 
 
 		 368 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  35.69 
 
 		 315 aa  179  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  33.04 
 
 		 343 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  36 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  30.52 
 
 		 358 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  35.95 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>