228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2216 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
355 aa  747    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  64.55 
 
 
380 aa  525  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  64.02 
 
 
370 aa  496  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  58.26 
 
 
429 aa  443  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  57.43 
 
 
403 aa  419  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  52.46 
 
 
357 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  54.02 
 
 
354 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  55.29 
 
 
355 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  53.47 
 
 
355 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  53.78 
 
 
355 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  55.12 
 
 
356 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  54.82 
 
 
356 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  53.17 
 
 
355 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  52.87 
 
 
355 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  52.87 
 
 
355 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  53.17 
 
 
355 aa  378  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  51.38 
 
 
379 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  52.57 
 
 
355 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0521  phosphotransferase enzyme family protein  51.28 
 
 
358 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828343  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  51.21 
 
 
354 aa  362  5.0000000000000005e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2515  phosphotransferase enzyme family protein  51.57 
 
 
358 aa  360  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0946  phosphotransferase enzyme family protein  51.57 
 
 
876 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2653  phosphotransferase enzyme family protein  51.57 
 
 
358 aa  359  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0243  phosphotransferase enzyme family protein  51.28 
 
 
358 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0279  phosphotransferase enzyme family protein  51.28 
 
 
358 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.438432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1426  phosphotransferase enzyme family protein  51.28 
 
 
358 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1623  phosphotransferase enzyme family protein  51.28 
 
 
358 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  43.91 
 
 
361 aa  323  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  48.17 
 
 
354 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  43.06 
 
 
348 aa  312  5.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  44.04 
 
 
348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  40.79 
 
 
353 aa  273  5.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  38.86 
 
 
363 aa  265  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  36.62 
 
 
350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  37.89 
 
 
362 aa  253  5.000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  37.73 
 
 
344 aa  252  7e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  35.42 
 
 
352 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  38.41 
 
 
357 aa  239  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  33.93 
 
 
351 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 
338 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  33.74 
 
 
358 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  34.3 
 
 
344 aa  196  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  31.09 
 
 
353 aa  193  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  33.04 
 
 
352 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  33.14 
 
 
359 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  34.3 
 
 
353 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  31.64 
 
 
364 aa  186  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.12 
 
 
815 aa  186  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  30.75 
 
 
353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  31.56 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  33.44 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  35.37 
 
 
368 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  32.39 
 
 
336 aa  180  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  31.96 
 
 
344 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  33.86 
 
 
353 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  35.14 
 
 
358 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  32.51 
 
 
352 aa  179  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  34.19 
 
 
344 aa  179  9e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  33.84 
 
 
362 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  34.45 
 
 
368 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  33.84 
 
 
362 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  30.67 
 
 
347 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  34.37 
 
 
353 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  32.83 
 
 
358 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  30.86 
 
 
349 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  34.15 
 
 
368 aa  175  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  33.13 
 
 
368 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  32.01 
 
 
355 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  33.75 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  35 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  33.55 
 
 
345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  34.6 
 
 
359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  31.33 
 
 
349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  32.83 
 
 
368 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  33.93 
 
 
358 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  34.58 
 
 
343 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  33.14 
 
 
361 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  31.89 
 
 
339 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  31.16 
 
 
354 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  34.39 
 
 
358 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  32.6 
 
 
358 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  33.55 
 
 
348 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  32.52 
 
 
368 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  32.52 
 
 
368 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  32.52 
 
 
368 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  32.52 
 
 
368 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  32.52 
 
 
368 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  32.52 
 
 
368 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  32.26 
 
 
347 aa  169  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  32.61 
 
 
388 aa  169  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  33.88 
 
 
339 aa  169  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  32.54 
 
 
361 aa  169  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  31.07 
 
 
338 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  31.86 
 
 
348 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  30.55 
 
 
356 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  32.36 
 
 
353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  32.45 
 
 
361 aa  165  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  31.96 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  31.19 
 
 
361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  32.91 
 
 
353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>