239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2476 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
338 aa  655    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  61.86 
 
 
338 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  60.66 
 
 
339 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  57.4 
 
 
341 aa  363  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  59.05 
 
 
451 aa  361  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  55.62 
 
 
338 aa  348  9e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  58.31 
 
 
350 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  53.35 
 
 
315 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  54.82 
 
 
344 aa  315  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  55.43 
 
 
354 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  53.85 
 
 
356 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  48.97 
 
 
359 aa  288  8e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  51.55 
 
 
353 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  45.61 
 
 
349 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  47.77 
 
 
347 aa  272  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  50.78 
 
 
344 aa  270  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  49.37 
 
 
338 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  49.37 
 
 
338 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  49.37 
 
 
338 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  46.2 
 
 
339 aa  249  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  44.54 
 
 
351 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1204  aminoglycoside phosphotransferase  46.2 
 
 
340 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  44.91 
 
 
339 aa  237  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  40.74 
 
 
344 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  40.57 
 
 
348 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  36.61 
 
 
363 aa  216  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  41.67 
 
 
353 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  41.85 
 
 
355 aa  209  5e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18680  predicted aminoglycoside phosphotransferase  40.69 
 
 
357 aa  209  7e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.571289 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  36.73 
 
 
348 aa  208  9e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  41.29 
 
 
348 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  41.64 
 
 
362 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  38.24 
 
 
355 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  36.34 
 
 
361 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  37.93 
 
 
355 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  39.63 
 
 
349 aa  202  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  36.68 
 
 
355 aa  202  7e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  38.2 
 
 
355 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  36.39 
 
 
356 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  40.25 
 
 
350 aa  200  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  39.46 
 
 
347 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  37.71 
 
 
352 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  36.96 
 
 
355 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  38.72 
 
 
352 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  42 
 
 
352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  36.07 
 
 
345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  34.31 
 
 
344 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  37.37 
 
 
391 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  37.3 
 
 
355 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  35.29 
 
 
355 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  38.14 
 
 
353 aa  192  8e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  34.55 
 
 
351 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  35.01 
 
 
388 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  36.03 
 
 
352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  38.32 
 
 
358 aa  190  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  36.86 
 
 
359 aa  189  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  36.92 
 
 
357 aa  189  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  35.69 
 
 
356 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  36.87 
 
 
365 aa  188  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  35.17 
 
 
352 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  36.89 
 
 
379 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  37.5 
 
 
358 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0618  putative phosphotransferase  38.73 
 
 
350 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172758  normal  0.0703036 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  35.69 
 
 
356 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  37.94 
 
 
353 aa  187  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  36.76 
 
 
357 aa  186  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  36.45 
 
 
355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  35.81 
 
 
353 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  36.42 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  37.99 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  36.2 
 
 
343 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  38.81 
 
 
342 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  32.94 
 
 
354 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  38.08 
 
 
346 aa  182  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  37.3 
 
 
358 aa  182  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  36.07 
 
 
362 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  34.43 
 
 
352 aa  182  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  36.07 
 
 
362 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  38.98 
 
 
343 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  40.34 
 
 
344 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  38.08 
 
 
346 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  36.58 
 
 
343 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  40.07 
 
 
344 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  37.25 
 
 
364 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  37.8 
 
 
343 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  32.27 
 
 
354 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  38.95 
 
 
339 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  35.1 
 
 
358 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  34.45 
 
 
354 aa  176  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  35.29 
 
 
337 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  39.43 
 
 
357 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0370  aminoglycoside phosphotransferase  38.05 
 
 
345 aa  175  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.380981  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  39.06 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  31.78 
 
 
355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  33.53 
 
 
354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  35.87 
 
 
354 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  30.47 
 
 
380 aa  172  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  33.24 
 
 
429 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  36.97 
 
 
343 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>