255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4490 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
344 aa  698    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  90.41 
 
 
344 aa  640    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  54 
 
 
358 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  51.43 
 
 
362 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  51.43 
 
 
362 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  50.29 
 
 
361 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  54.22 
 
 
346 aa  352  5e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  50.29 
 
 
358 aa  352  7e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  53.92 
 
 
346 aa  350  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  51.36 
 
 
358 aa  348  8e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 
358 aa  345  8e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  50.72 
 
 
368 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  48.27 
 
 
364 aa  339  5e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 
353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  51.14 
 
 
361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  50.29 
 
 
368 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  52.62 
 
 
345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  50.86 
 
 
361 aa  335  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  49.71 
 
 
353 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  51.42 
 
 
361 aa  333  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  49.86 
 
 
368 aa  332  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  48.83 
 
 
354 aa  332  7.000000000000001e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  50.95 
 
 
337 aa  331  1e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  54.15 
 
 
339 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  47.78 
 
 
363 aa  325  5e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  46.86 
 
 
361 aa  323  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  49.13 
 
 
353 aa  322  5e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  49.14 
 
 
368 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  49.84 
 
 
355 aa  318  7e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  52.48 
 
 
358 aa  317  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  48.12 
 
 
356 aa  318  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  48.2 
 
 
368 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  47.43 
 
 
362 aa  314  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  47.23 
 
 
359 aa  313  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  46.53 
 
 
363 aa  311  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  50.62 
 
 
363 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  48.29 
 
 
368 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  48.29 
 
 
368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  48.29 
 
 
368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  48.29 
 
 
368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  48.29 
 
 
368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  48.29 
 
 
368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  48 
 
 
368 aa  305  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  52.79 
 
 
342 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  46.18 
 
 
391 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  46.02 
 
 
352 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  45.88 
 
 
353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  46.45 
 
 
352 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  48.04 
 
 
344 aa  301  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  47.25 
 
 
344 aa  298  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  45.06 
 
 
352 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  47.04 
 
 
353 aa  295  9e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  44.87 
 
 
352 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  48.33 
 
 
358 aa  294  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  52.6 
 
 
343 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  52.44 
 
 
357 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  52.6 
 
 
343 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  52.6 
 
 
343 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  51.79 
 
 
343 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  51.62 
 
 
343 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  46.62 
 
 
354 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  51.13 
 
 
343 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  51.99 
 
 
343 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  51.66 
 
 
343 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  52.58 
 
 
337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  42.61 
 
 
388 aa  273  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  46.84 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  42.98 
 
 
348 aa  264  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  47.54 
 
 
352 aa  262  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  37.6 
 
 
382 aa  219  6e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  37.69 
 
 
364 aa  217  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  38.7 
 
 
401 aa  215  9e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  42.86 
 
 
354 aa  210  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  40.4 
 
 
338 aa  210  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  38.94 
 
 
339 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  39.88 
 
 
350 aa  200  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 
356 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  38.16 
 
 
338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  37.84 
 
 
344 aa  195  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  37 
 
 
341 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  40.59 
 
 
349 aa  192  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  38.7 
 
 
344 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  38.39 
 
 
315 aa  189  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  39.29 
 
 
353 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  42.06 
 
 
264 aa  189  7e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  36.83 
 
 
357 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  35.99 
 
 
348 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  41.67 
 
 
347 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  39.45 
 
 
350 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  38.62 
 
 
362 aa  186  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  36.09 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  36.09 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  37.28 
 
 
359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  36.09 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  32.47 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  33.24 
 
 
351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  39.27 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  37.7 
 
 
349 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  36.76 
 
 
353 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  33.43 
 
 
354 aa  182  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>