242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2112 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
353 aa  733    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  48.82 
 
 
362 aa  342  7e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  50.73 
 
 
356 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  48.82 
 
 
362 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  48.39 
 
 
358 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  48.97 
 
 
358 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  49.06 
 
 
345 aa  334  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  48.37 
 
 
358 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  47.01 
 
 
364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  49.39 
 
 
354 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  47.04 
 
 
359 aa  324  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 
355 aa  323  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  49.13 
 
 
344 aa  322  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  46.69 
 
 
361 aa  322  8e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  48.55 
 
 
344 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  51.08 
 
 
368 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  46.57 
 
 
354 aa  319  3.9999999999999996e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  47.55 
 
 
361 aa  319  6e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  47.26 
 
 
361 aa  318  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  49.38 
 
 
368 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  49.1 
 
 
353 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  45.56 
 
 
344 aa  316  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  46.69 
 
 
363 aa  316  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  48.45 
 
 
368 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  50.62 
 
 
363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  48.17 
 
 
361 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  48.14 
 
 
368 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  47.93 
 
 
343 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  47.56 
 
 
357 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  49.85 
 
 
368 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  49.84 
 
 
346 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  47.2 
 
 
353 aa  309  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  49.85 
 
 
368 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  49.85 
 
 
368 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  49.85 
 
 
368 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  49.85 
 
 
368 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  49.85 
 
 
368 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  46.49 
 
 
363 aa  308  6.999999999999999e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  44.74 
 
 
352 aa  308  8e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  46.9 
 
 
353 aa  308  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  45.48 
 
 
358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  45.65 
 
 
391 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  49.68 
 
 
346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  49.54 
 
 
368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  47.31 
 
 
352 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  45.82 
 
 
361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  44.69 
 
 
344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  47.63 
 
 
343 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  44.61 
 
 
353 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  46.62 
 
 
337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  47.93 
 
 
343 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  47.93 
 
 
343 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  45.82 
 
 
362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  47.93 
 
 
343 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  47.18 
 
 
343 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  48.9 
 
 
342 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  44.38 
 
 
348 aa  299  5e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  50.17 
 
 
339 aa  298  7e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  46.15 
 
 
352 aa  298  8e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  47.77 
 
 
343 aa  296  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  43.71 
 
 
388 aa  297  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  47.18 
 
 
368 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  43.24 
 
 
352 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  47.63 
 
 
343 aa  285  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  46.86 
 
 
358 aa  282  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  45.02 
 
 
358 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  45 
 
 
336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  45.25 
 
 
352 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  47.87 
 
 
337 aa  236  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  39.42 
 
 
349 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  38.51 
 
 
401 aa  216  5e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  35.39 
 
 
382 aa  208  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  37.74 
 
 
338 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  37.62 
 
 
355 aa  205  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  35.42 
 
 
348 aa  205  9e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  35.28 
 
 
350 aa  205  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  39.06 
 
 
356 aa  202  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  37.3 
 
 
355 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  35.69 
 
 
348 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  38.46 
 
 
339 aa  200  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  37.32 
 
 
361 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  33.06 
 
 
364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  36.81 
 
 
355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  35.78 
 
 
355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  37.17 
 
 
355 aa  197  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  39.42 
 
 
315 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  38.44 
 
 
356 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  35.29 
 
 
338 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  42.31 
 
 
264 aa  195  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  34.86 
 
 
355 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  40.07 
 
 
344 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  37.42 
 
 
349 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  34.86 
 
 
355 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  38.11 
 
 
348 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  35.78 
 
 
355 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  37.88 
 
 
357 aa  192  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  33.61 
 
 
353 aa  192  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  35.78 
 
 
355 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  32.94 
 
 
353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  34.3 
 
 
355 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>