228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1003 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 337 aa  662    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  52.16 
 
 		 358 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  58.54 
 
 		 339 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  56.07 
 
 		 358 aa  312  6.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  52.58 
 
 		 344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  53.23 
 
 		 344 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  46.79 
 
 		 345 aa  292  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  51.76 
 
 		 346 aa  292  7e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  51.76 
 
 		 346 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  43.57 
 
 		 337 aa  272  7e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  47.13 
 
 		 356 aa  269  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  43.67 
 
 		 358 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  42.81 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  47.25 
 
 		 355 aa  266  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  46.57 
 
 		 353 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  45.19 
 
 		 361 aa  265  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  44.1 
 
 		 352 aa  264  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  46.57 
 
 		 353 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  45.11 
 
 		 358 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  47.57 
 
 		 353 aa  261  8.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  45.16 
 
 		 362 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  44.16 
 
 		 358 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  45.18 
 
 		 368 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  45.16 
 
 		 362 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  46.36 
 
 		 361 aa  260  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  43.43 
 
 		 354 aa  258  8e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  45.48 
 
 		 368 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  44.79 
 
 		 342 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  46.37 
 
 		 353 aa  255  6e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  42.27 
 
 		 361 aa  255  7e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  45.79 
 
 		 362 aa  255  7e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  44.48 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  43.69 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  47.46 
 
 		 361 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  46.9 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  40.84 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  45.09 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  45.67 
 
 		 368 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  44.65 
 
 		 359 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  45.67 
 
 		 368 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  45.67 
 
 		 368 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  41.25 
 
 		 344 aa  249  5e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  45.67 
 
 		 368 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  45.67 
 
 		 368 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  45.67 
 
 		 368 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  44.78 
 
 		 343 aa  248  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  45.37 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  46.3 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  44.48 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  43.11 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  42.81 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  44.48 
 
 		 352 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  44.54 
 
 		 343 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  43.83 
 
 		 363 aa  246  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  44.54 
 
 		 343 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  44.54 
 
 		 343 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  44.58 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  43.45 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  43.95 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  41.82 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  44.18 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  43.08 
 
 		 352 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  43.58 
 
 		 357 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  42.81 
 
 		 352 aa  238  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  42.26 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  41.23 
 
 		 358 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  41.37 
 
 		 348 aa  226  5.0000000000000005e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  37.95 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  44.15 
 
 		 352 aa  212  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  42.94 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  36.86 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  41.5 
 
 		 355 aa  193  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  41.35 
 
 		 356 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  40.79 
 
 		 341 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  40.13 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  37.35 
 
 		 339 aa  186  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  43.58 
 
 		 264 aa  186  6e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  36.26 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  34.3 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  40.65 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  38.02 
 
 		 338 aa  178  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  38.36 
 
 		 349 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  38.37 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  36.77 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  39.94 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  34.02 
 
 		 355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  38.24 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  34.99 
 
 		 348 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  37.22 
 
 		 338 aa  169  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  38.53 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  35.33 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  33.23 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  40.27 
 
 		 347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  36.75 
 
 		 353 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  33.84 
 
 		 348 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  37.79 
 
 		 347 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  32.64 
 
 		 355 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  37.2 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  38.6 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  33.44 
 
 		 354 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>