239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1478 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 353 aa  726    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  73.68 
 
 		 355 aa  530  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  63.08 
 
 		 353 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  63.93 
 
 		 353 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  57.02 
 
 		 354 aa  408  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  59.13 
 
 		 359 aa  401  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  54.67 
 
 		 361 aa  391  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  54.15 
 
 		 364 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  55.1 
 
 		 362 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  55.1 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  56.73 
 
 		 368 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  54.96 
 
 		 368 aa  381  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  53.54 
 
 		 358 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  56.14 
 
 		 368 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  54.13 
 
 		 352 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  55.97 
 
 		 363 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  54.52 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  56.4 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  53.71 
 
 		 353 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  53.49 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  53.58 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  54.44 
 
 		 361 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  53.09 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  55.69 
 
 		 368 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  55.69 
 
 		 368 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  55.69 
 
 		 368 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  53.43 
 
 		 352 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  55.69 
 
 		 368 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  52.01 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  53.6 
 
 		 391 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  55.69 
 
 		 368 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  53.95 
 
 		 363 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  55.69 
 
 		 368 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  53.58 
 
 		 361 aa  364  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  52.54 
 
 		 362 aa  364  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  53.3 
 
 		 361 aa  363  2e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  55.39 
 
 		 368 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  54.39 
 
 		 368 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  51.9 
 
 		 358 aa  360  2e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  51.6 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 		 345 aa  340  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  53.5 
 
 		 343 aa  335  7e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  53.5 
 
 		 343 aa  335  7e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  52.89 
 
 		 343 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  53.19 
 
 		 343 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  50.86 
 
 		 357 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  46.83 
 
 		 344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  48.78 
 
 		 348 aa  325  8.000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  48.96 
 
 		 353 aa  325  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  51.81 
 
 		 343 aa  323  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  51.37 
 
 		 343 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  51.06 
 
 		 342 aa  322  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  50.16 
 
 		 346 aa  322  5e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  49.84 
 
 		 346 aa  322  7e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  51.53 
 
 		 343 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  49.85 
 
 		 343 aa  316  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  50.8 
 
 		 354 aa  315  6e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  50.74 
 
 		 352 aa  315  8e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  47.12 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  45.95 
 
 		 356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  47.35 
 
 		 352 aa  312  4.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  45.35 
 
 		 344 aa  308  8e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  47.04 
 
 		 344 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  44.84 
 
 		 344 aa  292  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  45.07 
 
 		 358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  46.71 
 
 		 339 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  46.27 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  43.12 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  47.51 
 
 		 337 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  36.56 
 
 		 401 aa  226  5.0000000000000005e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  36.93 
 
 		 364 aa  221  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0403488 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  37.12 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  38.29 
 
 		 348 aa  199  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  36.2 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  35.55 
 
 		 355 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  41.63 
 
 		 264 aa  187  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  36.72 
 
 		 339 aa  186  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  35.31 
 
 		 355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  35.01 
 
 		 355 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  35.29 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  35.36 
 
 		 356 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  33.81 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  37.16 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  35.07 
 
 		 356 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  34.12 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  33.94 
 
 		 348 aa  176  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  34.67 
 
 		 358 aa  175  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  36.48 
 
 		 349 aa  175  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  34.59 
 
 		 361 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  38.8 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  38.28 
 
 		 344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  34.12 
 
 		 355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  34.12 
 
 		 355 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  36.89 
 
 		 339 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  33.87 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  36.48 
 
 		 353 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  31.86 
 
 		 344 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  36.33 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  35.78 
 
 		 347 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  34.37 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>