251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0232 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  99.13 
 
 
346 aa  699    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
346 aa  702    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  60.53 
 
 
337 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  58.88 
 
 
362 aa  421  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  58.58 
 
 
362 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  58.08 
 
 
358 aa  408  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  58.21 
 
 
358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  60.18 
 
 
368 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  59.58 
 
 
368 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  57.66 
 
 
358 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  56.64 
 
 
361 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  57.94 
 
 
361 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  57.1 
 
 
361 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  58.58 
 
 
368 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  57.43 
 
 
368 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  57.43 
 
 
368 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  57.43 
 
 
368 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  58.53 
 
 
361 aa  381  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  57.43 
 
 
368 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  57.43 
 
 
368 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  57.14 
 
 
368 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  57.43 
 
 
368 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  58.7 
 
 
361 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  57.43 
 
 
368 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  57.43 
 
 
363 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  55.4 
 
 
368 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  57.76 
 
 
362 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  53.1 
 
 
345 aa  364  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  54.97 
 
 
363 aa  362  6e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  53.56 
 
 
363 aa  358  7e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  53.92 
 
 
344 aa  350  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  53.61 
 
 
344 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  49.39 
 
 
354 aa  346  4e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  50.74 
 
 
344 aa  345  5e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  50.3 
 
 
354 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  49.55 
 
 
364 aa  343  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  51.36 
 
 
358 aa  334  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  48.66 
 
 
352 aa  331  1e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 
355 aa  329  3e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  48.51 
 
 
344 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 
353 aa  325  7e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  48.08 
 
 
356 aa  325  7e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 
353 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  48.63 
 
 
359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  50.16 
 
 
353 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  52.41 
 
 
339 aa  311  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  48.65 
 
 
342 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  49.68 
 
 
358 aa  307  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  49.68 
 
 
353 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  48.51 
 
 
343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  49.85 
 
 
343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  49.55 
 
 
343 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  46.04 
 
 
352 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  48.66 
 
 
343 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  49.55 
 
 
343 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  48.57 
 
 
352 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  47.01 
 
 
348 aa  306  5.0000000000000004e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  49.55 
 
 
343 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  48.25 
 
 
391 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  49.25 
 
 
357 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  45.73 
 
 
352 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  48.8 
 
 
343 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  47.62 
 
 
388 aa  299  5e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  46.67 
 
 
353 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  48.41 
 
 
358 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  47.31 
 
 
343 aa  291  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  45.94 
 
 
336 aa  280  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  50.48 
 
 
352 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  51.22 
 
 
337 aa  267  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  41.02 
 
 
382 aa  235  7e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  35.29 
 
 
364 aa  232  9e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  43.55 
 
 
401 aa  232  9e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  37.83 
 
 
338 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  39.94 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  39.94 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  39.94 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  39.22 
 
 
339 aa  199  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  37.15 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  38.41 
 
 
359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  40.73 
 
 
355 aa  195  9e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  38.91 
 
 
344 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  37.76 
 
 
338 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  37.26 
 
 
354 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  39.71 
 
 
341 aa  193  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  37.57 
 
 
351 aa  192  8e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  35.31 
 
 
339 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  36.99 
 
 
339 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  35.95 
 
 
349 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  37.65 
 
 
353 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  37.88 
 
 
315 aa  186  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  39.73 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  36.57 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  44.1 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  38.13 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  35.83 
 
 
349 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  38.57 
 
 
353 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  38.7 
 
 
357 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  36.6 
 
 
348 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33361  protein serine/threonine kinase activity  31.43 
 
 
408 aa  181  1e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  37.78 
 
 
353 aa  182  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>