250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2068 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 344 aa  717    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  64.39 
 
 		 344 aa  478  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  64.41 
 
 		 345 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  64.16 
 
 		 352 aa  459  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  58.93 
 
 		 342 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  59.7 
 
 		 343 aa  401  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  58.08 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  58.38 
 
 		 343 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  58.38 
 
 		 343 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  58.68 
 
 		 357 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  58.38 
 
 		 343 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  58.38 
 
 		 343 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  55.69 
 
 		 343 aa  381  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  54.49 
 
 		 343 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  51.52 
 
 		 358 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  52.99 
 
 		 368 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  52.4 
 
 		 368 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  48.97 
 
 		 358 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  49.7 
 
 		 358 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  49.1 
 
 		 362 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  49.12 
 
 		 361 aa  349  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  48.5 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  49.4 
 
 		 361 aa  346  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  50.6 
 
 		 368 aa  342  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  52.96 
 
 		 336 aa  340  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  49.41 
 
 		 361 aa  341  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  50.6 
 
 		 361 aa  341  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  48.21 
 
 		 361 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  49.7 
 
 		 368 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  48.65 
 
 		 364 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  47.86 
 
 		 368 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  50.96 
 
 		 363 aa  333  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  50 
 
 		 368 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  50 
 
 		 368 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  49.85 
 
 		 354 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  50 
 
 		 368 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  50 
 
 		 368 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  50 
 
 		 368 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  50 
 
 		 368 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  48.21 
 
 		 346 aa  330  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  48.24 
 
 		 363 aa  329  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  48.51 
 
 		 346 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  49.7 
 
 		 368 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 		 388 aa  328  9e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  49.4 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  45.95 
 
 		 363 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  47.34 
 
 		 354 aa  324  1e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  47.02 
 
 		 358 aa  319  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  50.98 
 
 		 355 aa  317  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  47.92 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  46.46 
 
 		 337 aa  315  8e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  46.67 
 
 		 353 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  45.45 
 
 		 348 aa  310  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  48.35 
 
 		 344 aa  306  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  45.62 
 
 		 353 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  44.69 
 
 		 353 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  45.73 
 
 		 391 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  45.43 
 
 		 352 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  44.71 
 
 		 353 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  44.91 
 
 		 359 aa  302  5.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  44.97 
 
 		 353 aa  302  7.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  48.04 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  45.32 
 
 		 352 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  43.98 
 
 		 352 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  47.35 
 
 		 352 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  42.31 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  42.14 
 
 		 358 aa  269  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  44.63 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  43.21 
 
 		 337 aa  226  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  36.01 
 
 		 401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  37.13 
 
 		 339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  43.41 
 
 		 264 aa  212  7.999999999999999e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  33.15 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  35.69 
 
 		 354 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  38.07 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  34.86 
 
 		 341 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  33.05 
 
 		 364 aa  202  5e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  34.46 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  33.53 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  33.03 
 
 		 355 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  33.03 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  33.23 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  37.93 
 
 		 348 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  34.42 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  33.03 
 
 		 355 aa  193  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  34.41 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  33.03 
 
 		 355 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  32.74 
 
 		 356 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  37.77 
 
 		 339 aa  188  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  34.49 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  31.64 
 
 		 356 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  38.63 
 
 		 353 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  35.82 
 
 		 349 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  35.86 
 
 		 351 aa  186  6e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 		 451 aa  186  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  34.3 
 
 		 353 aa  186  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  32.34 
 
 		 355 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  38.01 
 
 		 338 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  38.01 
 
 		 338 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>