241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0649 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
356 aa  742    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  51.69 
 
 
358 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  49.45 
 
 
364 aa  362  8e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 
362 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 
362 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  50.15 
 
 
344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  50.86 
 
 
358 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  49.01 
 
 
361 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  51.75 
 
 
345 aa  352  4e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  50.85 
 
 
368 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  49.72 
 
 
358 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  48.97 
 
 
354 aa  342  5e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  51.42 
 
 
354 aa  342  5.999999999999999e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  50.7 
 
 
361 aa  341  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  49.72 
 
 
368 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  50.73 
 
 
353 aa  340  2e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  49.29 
 
 
352 aa  335  5.999999999999999e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  48.07 
 
 
368 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  48.08 
 
 
363 aa  332  6e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  47.47 
 
 
361 aa  331  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  51.34 
 
 
342 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  47.62 
 
 
352 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  47.74 
 
 
368 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  48.38 
 
 
346 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  46.53 
 
 
359 aa  326  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  46.65 
 
 
353 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  48.03 
 
 
361 aa  325  6e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  48.31 
 
 
361 aa  325  6e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  49.7 
 
 
343 aa  325  7e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  48.08 
 
 
346 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  46.96 
 
 
352 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  47.83 
 
 
391 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  47.21 
 
 
362 aa  323  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  47.41 
 
 
358 aa  322  4e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  50.44 
 
 
343 aa  322  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  47.5 
 
 
368 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  47.25 
 
 
352 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  46.63 
 
 
355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  49.42 
 
 
357 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  48.12 
 
 
344 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  47.89 
 
 
368 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  47.89 
 
 
368 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  47.89 
 
 
368 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  47.5 
 
 
368 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  47.92 
 
 
344 aa  317  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  48.22 
 
 
348 aa  317  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  47.89 
 
 
368 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  50.45 
 
 
343 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  47.89 
 
 
368 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  49.71 
 
 
343 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  49.71 
 
 
343 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  49.71 
 
 
343 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  47.22 
 
 
368 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  46.88 
 
 
353 aa  315  8e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  46 
 
 
353 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  46.8 
 
 
344 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  47.58 
 
 
363 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  48.02 
 
 
363 aa  312  4.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  44.35 
 
 
388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  48.67 
 
 
343 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  45.51 
 
 
337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  46.75 
 
 
358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  45.95 
 
 
353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  46.76 
 
 
343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  48.23 
 
 
339 aa  302  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  45.54 
 
 
358 aa  287  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  45.78 
 
 
336 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  46.56 
 
 
352 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  49.82 
 
 
337 aa  251  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  39.89 
 
 
364 aa  249  5e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0403488 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  38.76 
 
 
382 aa  240  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  38.6 
 
 
339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  37.61 
 
 
338 aa  225  9e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  39.41 
 
 
341 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  39.17 
 
 
338 aa  223  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  37.53 
 
 
401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  41.84 
 
 
348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  34.09 
 
 
355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  37.78 
 
 
359 aa  212  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  34.65 
 
 
355 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  34.09 
 
 
355 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  38.12 
 
 
349 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  34.96 
 
 
348 aa  209  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  36.34 
 
 
348 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  39.02 
 
 
315 aa  205  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  37.65 
 
 
353 aa  205  9e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  35.48 
 
 
350 aa  202  6e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  33.81 
 
 
356 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  34.76 
 
 
355 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  33.81 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  45.38 
 
 
264 aa  200  3e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  36.18 
 
 
357 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  32.38 
 
 
354 aa  199  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  32.95 
 
 
355 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  40.26 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  33.62 
 
 
351 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  34.95 
 
 
339 aa  195  8.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  31.82 
 
 
355 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  36.79 
 
 
337 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  33.24 
 
 
354 aa  192  7e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>