222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5980 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
353 aa  706    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  53.17 
 
 
354 aa  324  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  56.65 
 
 
344 aa  321  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  52.6 
 
 
356 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  51.59 
 
 
349 aa  316  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  52.23 
 
 
339 aa  308  9e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  50.28 
 
 
341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  50.47 
 
 
338 aa  300  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  49.69 
 
 
359 aa  280  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  46.32 
 
 
338 aa  279  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  50.3 
 
 
315 aa  275  9e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  51.32 
 
 
338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  47.25 
 
 
344 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  47.62 
 
 
451 aa  249  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  45.62 
 
 
350 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  44.03 
 
 
347 aa  242  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18680  predicted aminoglycoside phosphotransferase  43.22 
 
 
357 aa  232  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.571289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  43.08 
 
 
348 aa  232  8.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  40.87 
 
 
353 aa  229  6e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  43.48 
 
 
339 aa  229  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  42.67 
 
 
352 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  41.47 
 
 
351 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  40.3 
 
 
348 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1204  aminoglycoside phosphotransferase  43.84 
 
 
340 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  43.21 
 
 
338 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  43.21 
 
 
338 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  43.21 
 
 
338 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  39.13 
 
 
352 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  40.35 
 
 
347 aa  216  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  41.82 
 
 
348 aa  215  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  38.44 
 
 
344 aa  215  8e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  41.12 
 
 
350 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  38.42 
 
 
361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  39.49 
 
 
359 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  37.72 
 
 
391 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  40.37 
 
 
357 aa  212  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  43.83 
 
 
352 aa  212  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  37.6 
 
 
352 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  41.91 
 
 
358 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  40.06 
 
 
365 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  42.72 
 
 
355 aa  210  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  41.16 
 
 
353 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  36.97 
 
 
363 aa  209  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  40.3 
 
 
353 aa  209  8e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  40.8 
 
 
339 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  40.3 
 
 
357 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  38.79 
 
 
353 aa  206  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  40.37 
 
 
345 aa  206  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  39.23 
 
 
388 aa  206  7e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  38.07 
 
 
352 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  39.66 
 
 
368 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  34.81 
 
 
351 aa  202  8e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  40.67 
 
 
362 aa  201  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  40.06 
 
 
358 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  42.62 
 
 
348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  41.38 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  38.84 
 
 
364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  41.28 
 
 
358 aa  199  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  39.83 
 
 
368 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  36.44 
 
 
344 aa  199  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  34.94 
 
 
352 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  40.49 
 
 
361 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  39.78 
 
 
343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  35.56 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  41.82 
 
 
362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  35.91 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  39.71 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  37.57 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  36.26 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  36.2 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  40.26 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  38.68 
 
 
368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  40.18 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  38.41 
 
 
358 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  35.91 
 
 
355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  35.28 
 
 
356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  39.02 
 
 
358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  39.58 
 
 
368 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  35.61 
 
 
355 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  40.78 
 
 
363 aa  196  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  38.27 
 
 
362 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  38.27 
 
 
362 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  39.22 
 
 
343 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  37.16 
 
 
363 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  33.8 
 
 
355 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  39.7 
 
 
343 aa  192  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.38 
 
 
815 aa  192  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  38.94 
 
 
357 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  38.7 
 
 
358 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  37.23 
 
 
363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  35.01 
 
 
355 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  39.34 
 
 
361 aa  189  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  39.21 
 
 
362 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  38.66 
 
 
343 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  38.66 
 
 
343 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  39.29 
 
 
344 aa  189  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  38.34 
 
 
361 aa  189  9e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  38.66 
 
 
343 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  34.01 
 
 
354 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  40.4 
 
 
337 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>