231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2397 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
362 aa  718    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  53.39 
 
 
344 aa  342  8e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  51.8 
 
 
348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  49.02 
 
 
353 aa  323  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  48.6 
 
 
348 aa  319  3.9999999999999996e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  49.86 
 
 
361 aa  317  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  49.71 
 
 
350 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  45.58 
 
 
352 aa  298  8e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  44.6 
 
 
351 aa  295  6e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  41.83 
 
 
354 aa  293  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  44.64 
 
 
355 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  44.14 
 
 
355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  42.66 
 
 
354 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  42.42 
 
 
355 aa  279  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  45.48 
 
 
357 aa  279  6e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  41.64 
 
 
355 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  43.44 
 
 
355 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  42.77 
 
 
363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  42.98 
 
 
355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  42.69 
 
 
355 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  45.25 
 
 
358 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  42.57 
 
 
356 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  42.11 
 
 
355 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  42.27 
 
 
356 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  37.89 
 
 
355 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  38.69 
 
 
370 aa  250  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  42.73 
 
 
354 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2515  phosphotransferase enzyme family protein  41.27 
 
 
358 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0243  phosphotransferase enzyme family protein  41.27 
 
 
358 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0279  phosphotransferase enzyme family protein  41.27 
 
 
358 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.438432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1426  phosphotransferase enzyme family protein  41.27 
 
 
358 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1623  phosphotransferase enzyme family protein  41.27 
 
 
358 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  39.89 
 
 
429 aa  242  7.999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2653  phosphotransferase enzyme family protein  41 
 
 
358 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0946  phosphotransferase enzyme family protein  41.27 
 
 
876 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  41.59 
 
 
357 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  43.83 
 
 
379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  35.59 
 
 
380 aa  233  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0521  phosphotransferase enzyme family protein  39.71 
 
 
358 aa  232  9e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828343  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.83 
 
 
815 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  46.25 
 
 
356 aa  227  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  45 
 
 
344 aa  226  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  44.11 
 
 
354 aa  225  9e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  44.07 
 
 
344 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  36.68 
 
 
403 aa  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  42.61 
 
 
341 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  44.34 
 
 
339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  44.34 
 
 
338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  41.42 
 
 
349 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  41.14 
 
 
349 aa  208  9e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1653  aminoglycoside phosphotransferase  39.94 
 
 
377 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.793508  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  40.49 
 
 
359 aa  202  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  40.67 
 
 
353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  39.31 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  37.92 
 
 
347 aa  196  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  41.25 
 
 
362 aa  195  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  40.49 
 
 
338 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  37.5 
 
 
355 aa  192  6e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  34.28 
 
 
356 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  39.45 
 
 
451 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  35.65 
 
 
353 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  38.51 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  38.51 
 
 
348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  34.95 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  37.34 
 
 
358 aa  183  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  34.67 
 
 
344 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  37.9 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  37.9 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  37.9 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  40.45 
 
 
339 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  35.28 
 
 
353 aa  179  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  34.28 
 
 
344 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  40.36 
 
 
360 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  34.08 
 
 
362 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  35.65 
 
 
348 aa  175  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  32.45 
 
 
364 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1204  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 
340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  34.58 
 
 
345 aa  173  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  33.8 
 
 
362 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  34.56 
 
 
354 aa  172  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  34.44 
 
 
361 aa  172  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  35.14 
 
 
358 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  34.87 
 
 
352 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  37.06 
 
 
350 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  35.91 
 
 
347 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  34.29 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  36.86 
 
 
358 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  35.56 
 
 
359 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  36.83 
 
 
355 aa  165  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  34.25 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  34.58 
 
 
358 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  35.84 
 
 
343 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  34.04 
 
 
388 aa  164  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  33.8 
 
 
368 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  37.1 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  36.51 
 
 
352 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  34.56 
 
 
358 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  35.31 
 
 
361 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  34.37 
 
 
353 aa  162  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  32.94 
 
 
346 aa  162  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>