245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4543 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
359 aa  742    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  65.13 
 
 
352 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  64.27 
 
 
391 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  62.53 
 
 
364 aa  466  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  63.14 
 
 
352 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  62.86 
 
 
352 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  63.69 
 
 
353 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  61.71 
 
 
354 aa  449  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  59.94 
 
 
388 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  59.05 
 
 
358 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  60.62 
 
 
352 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  55.37 
 
 
362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  55.37 
 
 
362 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  56.3 
 
 
348 aa  402  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  59.13 
 
 
353 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  53.91 
 
 
358 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  56.82 
 
 
355 aa  391  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  52.91 
 
 
361 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  54.31 
 
 
358 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  55.91 
 
 
368 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  54.93 
 
 
361 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  55.62 
 
 
368 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  53.41 
 
 
358 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  53.6 
 
 
353 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  54.8 
 
 
361 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  52.99 
 
 
368 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  54.8 
 
 
361 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  52.74 
 
 
353 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  54.12 
 
 
363 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  53.67 
 
 
362 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  53.67 
 
 
361 aa  362  6e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  53.03 
 
 
368 aa  361  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  54.24 
 
 
363 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  52.81 
 
 
363 aa  358  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  53.14 
 
 
368 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  53.14 
 
 
368 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  53.14 
 
 
368 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  53.14 
 
 
368 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  53.14 
 
 
368 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  53.14 
 
 
368 aa  351  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  52.86 
 
 
368 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  52.86 
 
 
368 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  49.11 
 
 
344 aa  344  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  50.3 
 
 
345 aa  340  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  52.27 
 
 
342 aa  338  9e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  52.7 
 
 
343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  52.34 
 
 
343 aa  335  7e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  52.02 
 
 
343 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  52.02 
 
 
343 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  52.02 
 
 
343 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  51.4 
 
 
343 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  50.78 
 
 
354 aa  332  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  51.71 
 
 
357 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  50.61 
 
 
343 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  46.53 
 
 
356 aa  326  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  51.43 
 
 
343 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  47.04 
 
 
353 aa  324  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  52.16 
 
 
339 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  48.63 
 
 
346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  47.23 
 
 
344 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  48.33 
 
 
346 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  47.52 
 
 
344 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  47.92 
 
 
352 aa  302  5.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  44.91 
 
 
344 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  45.91 
 
 
337 aa  296  3e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  46.95 
 
 
358 aa  289  4e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  47.42 
 
 
336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  45.22 
 
 
358 aa  276  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  37.97 
 
 
364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  45.85 
 
 
337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  40.12 
 
 
349 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  37.15 
 
 
382 aa  224  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  41.39 
 
 
339 aa  223  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  38.14 
 
 
338 aa  216  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  41.14 
 
 
338 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  40.29 
 
 
355 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  39.13 
 
 
354 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  39.88 
 
 
355 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  41.67 
 
 
356 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  40.12 
 
 
355 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  35.81 
 
 
401 aa  210  3e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  41.67 
 
 
356 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  39.88 
 
 
353 aa  209  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  37.82 
 
 
356 aa  209  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  39.27 
 
 
341 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  39.71 
 
 
355 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  38.39 
 
 
355 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  37.93 
 
 
350 aa  205  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  39.12 
 
 
355 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  35.85 
 
 
348 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  37.39 
 
 
359 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  40.99 
 
 
357 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  38.63 
 
 
344 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  44.36 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  39.87 
 
 
344 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  38.35 
 
 
355 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  38.05 
 
 
355 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  37.5 
 
 
315 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  34.01 
 
 
344 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  35.93 
 
 
355 aa  193  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>