240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6920 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
348 aa  683    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  44.98 
 
 
338 aa  235  9e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  42.86 
 
 
339 aa  230  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  44.85 
 
 
353 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  41.61 
 
 
338 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  43.77 
 
 
347 aa  229  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  46.32 
 
 
354 aa  225  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  42.52 
 
 
350 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  41.84 
 
 
356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  44.65 
 
 
344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  43.69 
 
 
337 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  37.35 
 
 
344 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  40.45 
 
 
358 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  44.55 
 
 
352 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  41.19 
 
 
347 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  44.9 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  43.73 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  40.06 
 
 
349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  42.42 
 
 
359 aa  210  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  42.01 
 
 
341 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  39.01 
 
 
348 aa  206  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  38.51 
 
 
388 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  42.05 
 
 
362 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  41.11 
 
 
315 aa  203  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  42.86 
 
 
342 aa  202  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  41.88 
 
 
353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  38.19 
 
 
348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  42.49 
 
 
353 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  38.14 
 
 
364 aa  199  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  41.29 
 
 
338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  41.87 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  37.34 
 
 
354 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  38.06 
 
 
353 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  39.31 
 
 
354 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  40.39 
 
 
355 aa  194  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  35.46 
 
 
344 aa  194  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  37.93 
 
 
344 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  38.11 
 
 
353 aa  193  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  39.67 
 
 
358 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  42.11 
 
 
451 aa  192  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  41.64 
 
 
343 aa  192  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  40.62 
 
 
343 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  40.62 
 
 
343 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  36.77 
 
 
391 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  40.62 
 
 
343 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  40.44 
 
 
343 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  39.77 
 
 
350 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  38.73 
 
 
368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  36.13 
 
 
352 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  37.18 
 
 
359 aa  189  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  37.62 
 
 
352 aa  189  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  36.94 
 
 
358 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  34.48 
 
 
363 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  40.31 
 
 
357 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  36.99 
 
 
362 aa  185  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  39.17 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  39.94 
 
 
368 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  39.94 
 
 
368 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  37.94 
 
 
351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 
343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  36.43 
 
 
361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  38.51 
 
 
362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  42.23 
 
 
360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  39.94 
 
 
368 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  39.17 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  39.94 
 
 
368 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  39.17 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  39.94 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  39.94 
 
 
368 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  36.92 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  38.32 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  39.94 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  35.49 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1204  aminoglycoside phosphotransferase  39.06 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  39.42 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  37.07 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  38.22 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  39.73 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  36.25 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  39.38 
 
 
346 aa  183  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  36.13 
 
 
358 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  39.62 
 
 
368 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  40.32 
 
 
344 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  33.01 
 
 
354 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  36.68 
 
 
362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  37.42 
 
 
358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  36.99 
 
 
358 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  36.92 
 
 
361 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  35.37 
 
 
352 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  37.99 
 
 
339 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  33.87 
 
 
355 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  38.6 
 
 
344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  37.79 
 
 
365 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  37.93 
 
 
343 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  38.56 
 
 
368 aa  179  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1885  aminoglycoside phosphotransferase  37.2 
 
 
354 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  36.48 
 
 
345 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  37.41 
 
 
357 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  37.38 
 
 
352 aa  176  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  37.17 
 
 
339 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>