231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3481 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 353 aa  728    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  80.23 
 
 		 352 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  79.43 
 
 		 391 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  77.27 
 
 		 352 aa  580  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  75 
 
 		 352 aa  560  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  63.69 
 
 		 359 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  57.14 
 
 		 364 aa  434  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  61.34 
 
 		 352 aa  428  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  58.57 
 
 		 354 aa  431  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  58.79 
 
 		 358 aa  423  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  56.77 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  55.56 
 
 		 362 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  56.36 
 
 		 348 aa  404  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  55.56 
 
 		 362 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  55.71 
 
 		 358 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  54.15 
 
 		 353 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  53.14 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  53.5 
 
 		 353 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  51.7 
 
 		 358 aa  381  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  53.65 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  53.01 
 
 		 368 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  53.45 
 
 		 368 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  53.01 
 
 		 368 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  55.97 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  51.54 
 
 		 361 aa  368  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  51.26 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  53.71 
 
 		 353 aa  362  8e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  51 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  51 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  51 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  52.1 
 
 		 361 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  51 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  51 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  51 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  50.71 
 
 		 368 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  51.82 
 
 		 361 aa  358  7e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  51.28 
 
 		 368 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  50.28 
 
 		 368 aa  357  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  50.14 
 
 		 362 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  50 
 
 		 363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  51.26 
 
 		 363 aa  341  9e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  50.7 
 
 		 363 aa  339  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  48.04 
 
 		 344 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  48.63 
 
 		 345 aa  328  9e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  50.61 
 
 		 357 aa  328  9e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  46.65 
 
 		 356 aa  326  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  49.7 
 
 		 342 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 		 343 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  48.67 
 
 		 343 aa  325  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  48.18 
 
 		 343 aa  325  7e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  49.4 
 
 		 343 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  49.4 
 
 		 343 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  49.4 
 
 		 343 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  47.87 
 
 		 343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  46.67 
 
 		 344 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  47.11 
 
 		 343 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  47.01 
 
 		 354 aa  305  8.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  44.61 
 
 		 353 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  45.88 
 
 		 344 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  47.16 
 
 		 352 aa  302  8.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  46.98 
 
 		 346 aa  299  4e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  46.67 
 
 		 346 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  45.32 
 
 		 344 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  43.31 
 
 		 337 aa  289  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  44.41 
 
 		 358 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  43.93 
 
 		 336 aa  266  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  42.86 
 
 		 358 aa  266  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  43.62 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  39.43 
 
 		 364 aa  235  8e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  44.08 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  36.26 
 
 		 382 aa  215  7e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  35.53 
 
 		 401 aa  211  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  38.72 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  40.38 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  41.16 
 
 		 353 aa  209  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  38.34 
 
 		 341 aa  206  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  36.39 
 
 		 338 aa  205  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  40.65 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  39.03 
 
 		 344 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  39.41 
 
 		 339 aa  202  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  36.83 
 
 		 348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  37 
 
 		 347 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  38.06 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  38.82 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  36.67 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  36.99 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  36.81 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  34.91 
 
 		 355 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  35.09 
 
 		 356 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  37.86 
 
 		 344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  34.16 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  37.5 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  42.64 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  37.74 
 
 		 339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  34.91 
 
 		 356 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  34.04 
 
 		 355 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  34.86 
 
 		 354 aa  182  8.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  32.36 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  34.34 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  33.65 
 
 		 355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>