245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2629 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 368 aa  768    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  78.79 
 
 		 361 aa  608  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  77.81 
 
 		 361 aa  600  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  75.54 
 
 		 362 aa  582  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  74.73 
 
 		 361 aa  577  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  76.44 
 
 		 363 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  76.16 
 
 		 361 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  75.62 
 
 		 363 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  75.62 
 
 		 361 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  72.63 
 
 		 363 aa  535  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  68.13 
 
 		 368 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  68.21 
 
 		 362 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  67.93 
 
 		 362 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  66.48 
 
 		 368 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  66.58 
 
 		 358 aa  504  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  65.38 
 
 		 368 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  66.12 
 
 		 368 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  66.12 
 
 		 368 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  66.12 
 
 		 368 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  65.85 
 
 		 368 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  66.12 
 
 		 368 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  66.12 
 
 		 368 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  64.13 
 
 		 358 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  65.85 
 
 		 368 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  64.67 
 
 		 358 aa  491  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  64.11 
 
 		 368 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  54.08 
 
 		 354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  54.5 
 
 		 364 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  53.46 
 
 		 352 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  51.52 
 
 		 352 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  55.4 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  54.96 
 
 		 353 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  52.99 
 
 		 359 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  54.55 
 
 		 346 aa  371  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  51.93 
 
 		 391 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  50.69 
 
 		 352 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  51.25 
 
 		 358 aa  362  7.0000000000000005e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  54.95 
 
 		 355 aa  360  2e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  50.28 
 
 		 353 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 		 345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  50.42 
 
 		 353 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  49.72 
 
 		 353 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  53.54 
 
 		 354 aa  355  8.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 		 344 aa  350  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  48.84 
 
 		 337 aa  348  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  49.14 
 
 		 352 aa  344  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  48.9 
 
 		 388 aa  342  7e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  47.86 
 
 		 344 aa  334  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  48.07 
 
 		 356 aa  333  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  50.28 
 
 		 348 aa  333  4e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  50.29 
 
 		 343 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  50.41 
 
 		 352 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  50.29 
 
 		 343 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  50.29 
 
 		 343 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  49.57 
 
 		 343 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  49.27 
 
 		 343 aa  323  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  48.04 
 
 		 344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  49.56 
 
 		 357 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  48.2 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  47.73 
 
 		 343 aa  316  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  48.4 
 
 		 343 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  46.94 
 
 		 342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  46.31 
 
 		 343 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  47.18 
 
 		 353 aa  297  3e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  44.6 
 
 		 358 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  47.81 
 
 		 336 aa  280  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  47.17 
 
 		 339 aa  279  6e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  41.48 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  37.92 
 
 		 401 aa  230  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  43.17 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  35.93 
 
 		 364 aa  226  6e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0403488 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  34.63 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  37.61 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  39.69 
 
 		 353 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  34.09 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  40 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  41.35 
 
 		 264 aa  187  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  36.59 
 
 		 344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  34.56 
 
 		 349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  37.16 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02490  conserved hypothetical protein  31.27 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  35.96 
 
 		 357 aa  176  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  33.8 
 
 		 355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  36.34 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  36.29 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  35.96 
 
 		 362 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  35.94 
 
 		 339 aa  170  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33361  protein serine/threonine kinase activity  29.97 
 
 		 408 aa  169  5e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  36.53 
 
 		 354 aa  169  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  37.66 
 
 		 338 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  37.66 
 
 		 338 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  32.11 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  37.66 
 
 		 338 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  32.87 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  32.58 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  32.11 
 
 		 356 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  32.49 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  36.99 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  31.93 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  35.05 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>