222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18680 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_18680  predicted aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
357 aa  707    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.571289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  50.93 
 
 
351 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  49.1 
 
 
339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1204  aminoglycoside phosphotransferase  49.4 
 
 
340 aa  292  6e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  47.81 
 
 
338 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  47.81 
 
 
338 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  47.81 
 
 
338 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  47.11 
 
 
339 aa  280  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  46.3 
 
 
347 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  43.22 
 
 
353 aa  232  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  41.51 
 
 
341 aa  229  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  42.62 
 
 
338 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  39.06 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  41.54 
 
 
349 aa  215  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  40.92 
 
 
354 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  39.56 
 
 
338 aa  203  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  39.3 
 
 
338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  39.62 
 
 
344 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  38.57 
 
 
359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 
356 aa  196  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  41.06 
 
 
344 aa  195  9e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  38.96 
 
 
350 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  38.54 
 
 
315 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  39.55 
 
 
358 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  37.19 
 
 
451 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  41.3 
 
 
348 aa  178  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  39.26 
 
 
342 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  37.23 
 
 
337 aa  177  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  36.93 
 
 
358 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  33.71 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  38.05 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  37.19 
 
 
346 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  34.77 
 
 
353 aa  172  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  38.97 
 
 
358 aa  172  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  39.18 
 
 
368 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  36.75 
 
 
352 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  37.19 
 
 
346 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  38.76 
 
 
368 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  38.76 
 
 
368 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  38.76 
 
 
368 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  36.27 
 
 
358 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  38.76 
 
 
368 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  38.76 
 
 
368 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  38.76 
 
 
368 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  38.64 
 
 
368 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 
362 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 
362 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  38.76 
 
 
368 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  38.44 
 
 
368 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  37.81 
 
 
343 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  35.06 
 
 
349 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  35.83 
 
 
344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  38.32 
 
 
343 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  34.48 
 
 
353 aa  166  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  36.42 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  39.66 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  37.27 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  37.27 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  36.79 
 
 
361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  36.79 
 
 
361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 
354 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  37.27 
 
 
343 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  37.19 
 
 
348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  39.08 
 
 
344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  34.65 
 
 
361 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  34.85 
 
 
352 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  35.64 
 
 
345 aa  162  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  35.08 
 
 
355 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  34.63 
 
 
391 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  39.44 
 
 
344 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  33.44 
 
 
352 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  36.67 
 
 
363 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  37.46 
 
 
337 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  39.29 
 
 
339 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  35.17 
 
 
336 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  34.44 
 
 
358 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  38.78 
 
 
343 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  36.01 
 
 
352 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  41.56 
 
 
352 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  33.02 
 
 
364 aa  157  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 
350 aa  156  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  35.18 
 
 
355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  33.66 
 
 
353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  36.88 
 
 
362 aa  155  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  38.01 
 
 
357 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  30.84 
 
 
344 aa  155  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  33.85 
 
 
361 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  34.35 
 
 
359 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  36.45 
 
 
363 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  33.67 
 
 
348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  35.55 
 
 
363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  37.46 
 
 
343 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  37.11 
 
 
353 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  37.41 
 
 
368 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  32.8 
 
 
379 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  34.63 
 
 
353 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  35.53 
 
 
347 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  34.58 
 
 
358 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  32.65 
 
 
355 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  34.88 
 
 
361 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>