219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4129 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 358 aa  717    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.84 
 
 		 815 aa  363  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 		 350 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  46.04 
 
 		 348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  44.12 
 
 		 344 aa  285  7e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  46.36 
 
 		 348 aa  280  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  44.93 
 
 		 353 aa  276  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  40.7 
 
 		 355 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  43.35 
 
 		 357 aa  270  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  45.25 
 
 		 362 aa  267  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  38.44 
 
 		 355 aa  263  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  40.67 
 
 		 355 aa  262  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  40.06 
 
 		 351 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  43.14 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  40.67 
 
 		 355 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  41.16 
 
 		 356 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  41.64 
 
 		 356 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  38.27 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  38.66 
 
 		 355 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  41.03 
 
 		 355 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  39.45 
 
 		 355 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  38.9 
 
 		 352 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  39.14 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  39.07 
 
 		 363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  42.26 
 
 		 357 aa  232  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  39.83 
 
 		 429 aa  230  3e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  40.5 
 
 		 379 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  41.72 
 
 		 339 aa  226  6e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  41.81 
 
 		 354 aa  222  9e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  36.78 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  34.25 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  40.06 
 
 		 344 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  36.02 
 
 		 354 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  36.34 
 
 		 354 aa  210  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  40.38 
 
 		 344 aa  209  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  39.31 
 
 		 356 aa  209  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  33.74 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2653  phosphotransferase enzyme family protein  37.61 
 
 		 358 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  39.88 
 
 		 341 aa  205  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  41.64 
 
 		 353 aa  205  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0243  phosphotransferase enzyme family protein  37.61 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0521  phosphotransferase enzyme family protein  36.78 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828343  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1426  phosphotransferase enzyme family protein  37.61 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1623  phosphotransferase enzyme family protein  37.61 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0279  phosphotransferase enzyme family protein  37.61 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.438432  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2515  phosphotransferase enzyme family protein  37.61 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  40.56 
 
 		 362 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  34.49 
 
 		 380 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0946  phosphotransferase enzyme family protein  37.61 
 
 		 876 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  36.89 
 
 		 349 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  37.61 
 
 		 353 aa  196  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  37.01 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  37.76 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  37.68 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  37.03 
 
 		 353 aa  189  7e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  36.89 
 
 		 359 aa  186  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  37.79 
 
 		 347 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  41.67 
 
 		 360 aa  182  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  36.96 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  36.31 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  33.73 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  36.12 
 
 		 349 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  36.86 
 
 		 315 aa  179  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  33.91 
 
 		 354 aa  179  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  33.14 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  33.53 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  32.73 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  32.06 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1653  aminoglycoside phosphotransferase  34 
 
 		 377 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.793508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  34.29 
 
 		 354 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  35.67 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  33.03 
 
 		 352 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  35.17 
 
 		 345 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  36.48 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  34.29 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  35.42 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  37.16 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  38.72 
 
 		 348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  35.88 
 
 		 343 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  34.3 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  33.81 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  35.88 
 
 		 343 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  33.53 
 
 		 361 aa  169  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  34.67 
 
 		 353 aa  169  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  34.29 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  34.3 
 
 		 343 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  32.28 
 
 		 356 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  35.47 
 
 		 355 aa  166  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  35.14 
 
 		 353 aa  166  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  35.69 
 
 		 357 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  35.99 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  35.19 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  35.19 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  33.93 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  35.19 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  36.06 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  34.57 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  35.05 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  34.01 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  35.28 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>