230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0634 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 370 aa  777    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  63.1 
 
 		 380 aa  500  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  64.02 
 
 		 355 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  56.5 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  55.56 
 
 		 403 aa  436  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  51.14 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  52.27 
 
 		 354 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  49.71 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  48.73 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  49.71 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  49.71 
 
 		 355 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  50.45 
 
 		 379 aa  360  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  49.12 
 
 		 355 aa  358  7e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  48.25 
 
 		 355 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  48.67 
 
 		 354 aa  354  2e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  48.74 
 
 		 356 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  48.74 
 
 		 356 aa  352  5e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2653  phosphotransferase enzyme family protein  49.57 
 
 		 358 aa  348  6e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0946  phosphotransferase enzyme family protein  49.57 
 
 		 876 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2515  phosphotransferase enzyme family protein  49.57 
 
 		 358 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0521  phosphotransferase enzyme family protein  49.57 
 
 		 358 aa  345  5e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  46.48 
 
 		 355 aa  345  5e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0243  phosphotransferase enzyme family protein  49.29 
 
 		 358 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0279  phosphotransferase enzyme family protein  49.29 
 
 		 358 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.438432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1426  phosphotransferase enzyme family protein  49.29 
 
 		 358 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1623  phosphotransferase enzyme family protein  49.29 
 
 		 358 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  43.82 
 
 		 354 aa  306  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  43.02 
 
 		 348 aa  305  6e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  42.02 
 
 		 361 aa  302  5.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  41.6 
 
 		 348 aa  293  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  38.76 
 
 		 363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  36.89 
 
 		 351 aa  259  7e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  39.16 
 
 		 353 aa  252  6e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  38.69 
 
 		 362 aa  250  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  34.68 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  35.34 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  35.95 
 
 		 344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  32.44 
 
 		 350 aa  227  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  34.25 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  34.64 
 
 		 338 aa  200  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.2 
 
 		 815 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  36.43 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  32.83 
 
 		 356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  33.89 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  32.08 
 
 		 359 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  28.93 
 
 		 353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  31.87 
 
 		 349 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  32.68 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  33.77 
 
 		 354 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  33.01 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  30.81 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  32.72 
 
 		 352 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  31.1 
 
 		 338 aa  169  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  32.08 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  30.09 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  33.74 
 
 		 358 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  31.63 
 
 		 358 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  31.53 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 		 359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  32.65 
 
 		 358 aa  167  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  33.53 
 
 		 364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  30.06 
 
 		 355 aa  166  9e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  34.07 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  31.41 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  31.09 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  31.86 
 
 		 344 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  33.02 
 
 		 353 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 353 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  35.29 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  32.59 
 
 		 344 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  33.02 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  30.17 
 
 		 360 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  33.54 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  32.28 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  30.86 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  34.07 
 
 		 346 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  32.18 
 
 		 353 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  34.07 
 
 		 346 aa  156  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  30.86 
 
 		 336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  29.69 
 
 		 365 aa  156  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  32.54 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  32.63 
 
 		 353 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  30.36 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  32.32 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  30.7 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  31.4 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  30.82 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  30.27 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  31.96 
 
 		 368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  31.96 
 
 		 368 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  31.96 
 
 		 368 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  31.96 
 
 		 368 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  31.96 
 
 		 368 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  31.96 
 
 		 368 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  31.96 
 
 		 368 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1653  aminoglycoside phosphotransferase  27.02 
 
 		 377 aa  152  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.793508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  30.48 
 
 		 352 aa  152  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  31.95 
 
 		 342 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  31.08 
 
 		 354 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>