232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1910 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  92.39 
 
 		 355 aa  691    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  98.59 
 
 		 355 aa  733    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 355 aa  742    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  94.93 
 
 		 355 aa  706    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  81.13 
 
 		 355 aa  622  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  80.28 
 
 		 355 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  78.31 
 
 		 355 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  78.93 
 
 		 356 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  79.21 
 
 		 356 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  77.46 
 
 		 355 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  58.59 
 
 		 354 aa  437  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  52.26 
 
 		 354 aa  391  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  50.7 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  52.57 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  49.12 
 
 		 370 aa  358  6e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  46.65 
 
 		 361 aa  350  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  48.17 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0521  phosphotransferase enzyme family protein  50.57 
 
 		 358 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828343  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  46.88 
 
 		 403 aa  347  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  47.65 
 
 		 380 aa  343  4e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  49.41 
 
 		 348 aa  342  7e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2515  phosphotransferase enzyme family protein  49.43 
 
 		 358 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2653  phosphotransferase enzyme family protein  49.43 
 
 		 358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0946  phosphotransferase enzyme family protein  49.43 
 
 		 876 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0243  phosphotransferase enzyme family protein  49.14 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0279  phosphotransferase enzyme family protein  49.14 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.438432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1426  phosphotransferase enzyme family protein  49.14 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1623  phosphotransferase enzyme family protein  49.14 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  50.46 
 
 		 379 aa  332  5e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  45.33 
 
 		 348 aa  330  3e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  48.04 
 
 		 354 aa  328  6e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  43.44 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  43.38 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  42.6 
 
 		 344 aa  293  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  38.78 
 
 		 351 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  42.11 
 
 		 362 aa  265  5.999999999999999e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  38.51 
 
 		 350 aa  263  4e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  38.91 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  40.73 
 
 		 357 aa  249  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  41.03 
 
 		 358 aa  246  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.05 
 
 		 815 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  39.22 
 
 		 338 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  39.58 
 
 		 352 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  37.22 
 
 		 354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  36.45 
 
 		 359 aa  208  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  38.67 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  38.23 
 
 		 352 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  36.11 
 
 		 344 aa  205  8e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  39.71 
 
 		 359 aa  205  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  36.73 
 
 		 358 aa  204  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  36.42 
 
 		 365 aa  203  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  37.07 
 
 		 349 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  37.24 
 
 		 451 aa  202  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  39 
 
 		 344 aa  202  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  38.08 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  35.16 
 
 		 353 aa  200  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  35.23 
 
 		 356 aa  200  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  36.31 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  34.68 
 
 		 345 aa  199  7e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  33.84 
 
 		 353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  36.42 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  34.46 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  36.02 
 
 		 354 aa  196  7e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  35.78 
 
 		 347 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1653  aminoglycoside phosphotransferase  34.16 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.793508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  33.23 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  34.69 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  34.86 
 
 		 353 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  32.31 
 
 		 355 aa  193  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  34.9 
 
 		 343 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  37.29 
 
 		 353 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  35.37 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  37.46 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  31.53 
 
 		 356 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  36.68 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  32.47 
 
 		 352 aa  189  5.999999999999999e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  34.58 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  34.31 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  34.31 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  34.31 
 
 		 343 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  35.22 
 
 		 362 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  35.22 
 
 		 362 aa  186  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  34.22 
 
 		 343 aa  185  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  34.32 
 
 		 342 aa  185  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  34.21 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  31.96 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  35.83 
 
 		 362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  34.34 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  34.24 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  35.69 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  33.96 
 
 		 358 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  32.56 
 
 		 358 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  31.99 
 
 		 358 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  33.72 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  34.41 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  35.6 
 
 		 355 aa  178  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  30.81 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  36.77 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  35.11 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>