233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2209 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 350 aa  693    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  61.01 
 
 		 344 aa  431  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  48.18 
 
 		 348 aa  313  3.9999999999999997e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  48.17 
 
 		 348 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  49.56 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  45.77 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  49.28 
 
 		 358 aa  296  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  42.86 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  43.24 
 
 		 357 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  39.4 
 
 		 355 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  40.54 
 
 		 351 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  41.33 
 
 		 363 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  39.65 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  38.35 
 
 		 354 aa  276  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 		 355 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  41.14 
 
 		 355 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 		 355 aa  275  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  40.24 
 
 		 356 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  39.94 
 
 		 356 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  38.81 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  39.7 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.19 
 
 		 815 aa  270  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  39.77 
 
 		 354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  38.81 
 
 		 355 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  38.51 
 
 		 355 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0521  phosphotransferase enzyme family protein  42.36 
 
 		 358 aa  260  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828343  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2653  phosphotransferase enzyme family protein  42.15 
 
 		 358 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2515  phosphotransferase enzyme family protein  42.15 
 
 		 358 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  37.68 
 
 		 429 aa  257  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0243  phosphotransferase enzyme family protein  41.86 
 
 		 358 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0279  phosphotransferase enzyme family protein  41.86 
 
 		 358 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.438432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1426  phosphotransferase enzyme family protein  41.86 
 
 		 358 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1623  phosphotransferase enzyme family protein  41.86 
 
 		 358 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0946  phosphotransferase enzyme family protein  42.15 
 
 		 876 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  36.62 
 
 		 355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  41.11 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  41.36 
 
 		 357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  43.03 
 
 		 379 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  36.02 
 
 		 403 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1653  aminoglycoside phosphotransferase  41.71 
 
 		 377 aa  239  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.793508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  40.71 
 
 		 355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  40.11 
 
 		 353 aa  229  6e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  33.07 
 
 		 380 aa  228  9e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  32.83 
 
 		 370 aa  227  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  38.99 
 
 		 338 aa  226  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  39.1 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  39 
 
 		 353 aa  221  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  40.3 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  42.52 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  41.85 
 
 		 347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  40.81 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  42.12 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  39.94 
 
 		 344 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  38.92 
 
 		 349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  37.28 
 
 		 359 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  34 
 
 		 364 aa  210  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  36.98 
 
 		 349 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  38.18 
 
 		 338 aa  206  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  35.28 
 
 		 353 aa  205  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  39.22 
 
 		 362 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  36.28 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  38.46 
 
 		 359 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  35.34 
 
 		 356 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  39.36 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  38.48 
 
 		 356 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  37.43 
 
 		 354 aa  199  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  35.82 
 
 		 354 aa  197  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  35.35 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  39.21 
 
 		 338 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  38.42 
 
 		 360 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  40.06 
 
 		 352 aa  192  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  34.58 
 
 		 358 aa  192  8e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  33.82 
 
 		 352 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  35.4 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  36.28 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  34.32 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3748  aminoglycoside phosphotransferase  35.4 
 
 		 350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3736  aminoglycoside phosphotransferase  35.4 
 
 		 350 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3809  aminoglycoside phosphotransferase  35.4 
 
 		 350 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  35.16 
 
 		 355 aa  189  9e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  31.56 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  34.52 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  35.19 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  36.95 
 
 		 344 aa  186  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1885  aminoglycoside phosphotransferase  34.51 
 
 		 354 aa  185  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  36.42 
 
 		 343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  36.19 
 
 		 350 aa  184  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  35.69 
 
 		 342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  35.76 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  34.12 
 
 		 358 aa  182  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  34.18 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  34.5 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  36.91 
 
 		 451 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  33.63 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  34.64 
 
 		 353 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  32.46 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  35.67 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  36.63 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  34.23 
 
 		 353 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  35.61 
 
 		 357 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>