247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2519 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
349 aa  692    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  44.38 
 
 
339 aa  238  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  36.05 
 
 
354 aa  225  8e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  39.52 
 
 
349 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1885  aminoglycoside phosphotransferase  40.72 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  42.57 
 
 
344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  41.26 
 
 
365 aa  219  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  37.58 
 
 
344 aa  219  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  40.06 
 
 
355 aa  218  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  40.36 
 
 
357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  39.71 
 
 
359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0618  putative phosphotransferase  41.35 
 
 
350 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172758  normal  0.0703036 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  41.06 
 
 
338 aa  212  7.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0370  aminoglycoside phosphotransferase  40.6 
 
 
345 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.380981  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  37.46 
 
 
361 aa  210  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  43.62 
 
 
354 aa  209  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  38.63 
 
 
338 aa  208  9e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  41.14 
 
 
362 aa  208  9e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  43.37 
 
 
356 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  39.48 
 
 
350 aa  208  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  43.31 
 
 
341 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  39.32 
 
 
315 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  37.15 
 
 
355 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  38.72 
 
 
353 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  38.21 
 
 
353 aa  206  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2652  aminoglycoside phosphotransferase  42.01 
 
 
353 aa  206  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000355622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  37.38 
 
 
355 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2450  aminoglycoside phosphotransferase  41.35 
 
 
343 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6361  aminoglycoside phosphotransferase  42.95 
 
 
342 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00784596  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  38.58 
 
 
353 aa  203  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  37.66 
 
 
348 aa  203  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  37.07 
 
 
355 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  42.48 
 
 
344 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  36.56 
 
 
355 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  37.42 
 
 
354 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  34.69 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  36.05 
 
 
363 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  38.82 
 
 
358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3748  aminoglycoside phosphotransferase  42.35 
 
 
350 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4201  aminoglycoside phosphotransferase  40.72 
 
 
343 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3736  aminoglycoside phosphotransferase  42.35 
 
 
350 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  36.89 
 
 
358 aa  199  7e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3809  aminoglycoside phosphotransferase  42.35 
 
 
350 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  40.26 
 
 
339 aa  199  7.999999999999999e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  40.24 
 
 
362 aa  199  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  40.25 
 
 
338 aa  198  9e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  35.67 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  41.87 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  39.67 
 
 
347 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  32.66 
 
 
351 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  35.13 
 
 
355 aa  196  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1805  aminoglycoside phosphotransferase  38.79 
 
 
354 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1852  aminoglycoside phosphotransferase  38.79 
 
 
354 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.906902  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1786  aminoglycoside phosphotransferase  38.79 
 
 
354 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0286679  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  33.82 
 
 
355 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  36.96 
 
 
348 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  35.94 
 
 
356 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0861  aminoglycoside phosphotransferase  39.77 
 
 
354 aa  193  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.622757  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  37.42 
 
 
353 aa  194  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  40.59 
 
 
344 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  34.18 
 
 
355 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  34.83 
 
 
348 aa  192  8e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  34.78 
 
 
354 aa  192  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  35.62 
 
 
356 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  32.84 
 
 
352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  33.86 
 
 
355 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  42.9 
 
 
360 aa  189  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  33.04 
 
 
356 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4318  aminoglycoside phosphotransferase  37.99 
 
 
350 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  39.93 
 
 
344 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  33.96 
 
 
364 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0097  aminoglycoside phosphotransferase  37.34 
 
 
340 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.92974  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  35.83 
 
 
346 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  31.53 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  34.78 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  39.55 
 
 
451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  38.51 
 
 
353 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  32.01 
 
 
359 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  35.83 
 
 
346 aa  184  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 
362 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 
362 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  35.28 
 
 
368 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  36.45 
 
 
357 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  33.12 
 
 
358 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  31.5 
 
 
354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  40.34 
 
 
350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  34.82 
 
 
368 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2028  aminoglycoside phosphotransferase  36.5 
 
 
350 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00704541  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  35.31 
 
 
358 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  33.23 
 
 
352 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  31.87 
 
 
370 aa  176  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  33.54 
 
 
345 aa  176  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  29.86 
 
 
388 aa  176  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  36.22 
 
 
368 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  31.99 
 
 
344 aa  176  7e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  38.43 
 
 
339 aa  175  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  32.19 
 
 
358 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  34.64 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  31.33 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>