227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3418 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  85.92 
 
 
355 aa  656    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
355 aa  741    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  84.79 
 
 
355 aa  643    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  82.82 
 
 
355 aa  631  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  82.54 
 
 
355 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  83.15 
 
 
356 aa  630  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  82.25 
 
 
355 aa  631  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  82.87 
 
 
356 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  81.13 
 
 
355 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  80.28 
 
 
355 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  59.44 
 
 
354 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  52.92 
 
 
429 aa  394  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  52.26 
 
 
354 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  53.78 
 
 
355 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  48.58 
 
 
403 aa  368  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  48.88 
 
 
361 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 
370 aa  363  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0521  phosphotransferase enzyme family protein  51.14 
 
 
358 aa  360  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828343  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  48.44 
 
 
348 aa  358  9e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  50.14 
 
 
380 aa  356  2.9999999999999997e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2515  phosphotransferase enzyme family protein  51.16 
 
 
358 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2653  phosphotransferase enzyme family protein  51.16 
 
 
358 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 
348 aa  354  1e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  48.28 
 
 
357 aa  354  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0946  phosphotransferase enzyme family protein  51.16 
 
 
876 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0243  phosphotransferase enzyme family protein  50.87 
 
 
358 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0279  phosphotransferase enzyme family protein  50.87 
 
 
358 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.438432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1426  phosphotransferase enzyme family protein  50.87 
 
 
358 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1623  phosphotransferase enzyme family protein  50.87 
 
 
358 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  51.07 
 
 
379 aa  339  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  45.27 
 
 
354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  44.28 
 
 
344 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  43.44 
 
 
363 aa  299  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  43.97 
 
 
353 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  44.14 
 
 
362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  38.81 
 
 
350 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  39.02 
 
 
351 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  38.19 
 
 
352 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  40.73 
 
 
357 aa  255  8e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  38.66 
 
 
358 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  38.42 
 
 
354 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  36.69 
 
 
356 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  37.08 
 
 
359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.24 
 
 
815 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  38.07 
 
 
364 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  38.08 
 
 
338 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  39.25 
 
 
339 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  34.09 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  36.25 
 
 
353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  38.02 
 
 
349 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  35.96 
 
 
345 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  40.12 
 
 
359 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  38.91 
 
 
344 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  37.76 
 
 
352 aa  208  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  34.14 
 
 
353 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  36.18 
 
 
347 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  35.49 
 
 
344 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  36.88 
 
 
341 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  36.34 
 
 
354 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  34.02 
 
 
344 aa  203  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  33.63 
 
 
355 aa  202  8e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  37.3 
 
 
353 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1653  aminoglycoside phosphotransferase  34.51 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.793508  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  34.88 
 
 
358 aa  199  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  36.69 
 
 
362 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  36.69 
 
 
362 aa  199  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  37.39 
 
 
348 aa  199  9e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  35.91 
 
 
342 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  33.53 
 
 
352 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  35.13 
 
 
349 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  36.63 
 
 
451 aa  196  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  35.6 
 
 
338 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  36.79 
 
 
358 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  37.09 
 
 
363 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  37.46 
 
 
353 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  36.89 
 
 
339 aa  193  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  35.99 
 
 
358 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  35.47 
 
 
352 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  36.71 
 
 
391 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 
368 aa  192  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  33.03 
 
 
344 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  35.96 
 
 
358 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  37.62 
 
 
360 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  32.95 
 
 
352 aa  190  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 
355 aa  189  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  38.56 
 
 
352 aa  189  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  35.01 
 
 
315 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  36.39 
 
 
362 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  35.74 
 
 
338 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  34.62 
 
 
343 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  34.91 
 
 
353 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  34.9 
 
 
343 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  36.91 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  35.76 
 
 
361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  36.92 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  36.57 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  31.29 
 
 
358 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  34.38 
 
 
343 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  36.31 
 
 
388 aa  182  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  34.38 
 
 
361 aa  182  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>