233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4078 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
358 aa  717    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  54.37 
 
 
358 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  57.81 
 
 
339 aa  354  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  51.34 
 
 
344 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  52.48 
 
 
344 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  47.98 
 
 
346 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  47.66 
 
 
346 aa  298  7e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  43.79 
 
 
358 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  47.29 
 
 
342 aa  288  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  45.54 
 
 
356 aa  288  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  45.15 
 
 
368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  43.16 
 
 
362 aa  286  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  43.16 
 
 
362 aa  286  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  44.48 
 
 
337 aa  285  7e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  56.07 
 
 
337 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  44.55 
 
 
368 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  46.86 
 
 
353 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  46.53 
 
 
353 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  43.19 
 
 
358 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  43.79 
 
 
358 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  47.42 
 
 
348 aa  280  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  44.75 
 
 
361 aa  281  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  45.06 
 
 
361 aa  280  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  43.69 
 
 
345 aa  279  6e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  41.28 
 
 
361 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  46.85 
 
 
343 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  45.92 
 
 
353 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  47.15 
 
 
343 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  42.48 
 
 
344 aa  276  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  45.22 
 
 
359 aa  276  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  43.15 
 
 
363 aa  276  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  42.35 
 
 
354 aa  276  5e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  45.35 
 
 
343 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  42.86 
 
 
354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  46.85 
 
 
343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  46.85 
 
 
343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  42.86 
 
 
361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  46.85 
 
 
343 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  44.65 
 
 
352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  41.94 
 
 
344 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  46.55 
 
 
343 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  41.48 
 
 
368 aa  271  9e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  42.22 
 
 
361 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  44.04 
 
 
362 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  45.95 
 
 
357 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  41.25 
 
 
364 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  44.1 
 
 
368 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  42.06 
 
 
363 aa  269  7e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  44.41 
 
 
353 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  44.55 
 
 
368 aa  266  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  43.45 
 
 
391 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  44.58 
 
 
368 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  44.58 
 
 
368 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  44.58 
 
 
368 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  44.58 
 
 
368 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  44.58 
 
 
368 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  44.58 
 
 
368 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  44.27 
 
 
368 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  42.59 
 
 
363 aa  262  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  43.25 
 
 
358 aa  261  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  43.24 
 
 
343 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  42.17 
 
 
352 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  44.07 
 
 
355 aa  258  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  42.99 
 
 
353 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  40.48 
 
 
388 aa  253  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  39.76 
 
 
352 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  43.99 
 
 
336 aa  247  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  39.94 
 
 
352 aa  246  4e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  45.48 
 
 
352 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  40.57 
 
 
338 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  40.41 
 
 
344 aa  218  8.999999999999998e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  39.31 
 
 
382 aa  218  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  39.64 
 
 
354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  41.59 
 
 
347 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  40.41 
 
 
356 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  40.67 
 
 
315 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  39.75 
 
 
349 aa  205  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  37.97 
 
 
401 aa  204  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  35.65 
 
 
364 aa  202  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  36.61 
 
 
341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  39.63 
 
 
339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  38.49 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  37.69 
 
 
344 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  40.71 
 
 
353 aa  199  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 
359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  39.45 
 
 
348 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  36.22 
 
 
350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  34.43 
 
 
348 aa  194  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  36.63 
 
 
362 aa  193  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  37.04 
 
 
338 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  39.43 
 
 
355 aa  188  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  32.15 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  31.29 
 
 
355 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  34.75 
 
 
348 aa  182  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18680  predicted aminoglycoside phosphotransferase  39.55 
 
 
357 aa  182  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.571289 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  31.86 
 
 
354 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  36.09 
 
 
361 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  38.58 
 
 
339 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  30.95 
 
 
344 aa  180  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  37.46 
 
 
339 aa  179  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>