237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2861 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 345 aa  720    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  64.41 
 
 		 344 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  62.87 
 
 		 344 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  63.5 
 
 		 352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  61.38 
 
 		 342 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  59.29 
 
 		 343 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  59.88 
 
 		 357 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  59.29 
 
 		 343 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  59.29 
 
 		 343 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  58.7 
 
 		 343 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  59.29 
 
 		 343 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  59.29 
 
 		 343 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  56.05 
 
 		 343 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  56.16 
 
 		 343 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  56.02 
 
 		 358 aa  398  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  55.52 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  55.69 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  53.92 
 
 		 362 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  54.22 
 
 		 358 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  55.26 
 
 		 368 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  53.61 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  54.3 
 
 		 361 aa  381  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  54.3 
 
 		 361 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  53.43 
 
 		 368 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  52.4 
 
 		 368 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  53.35 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  53.71 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  53.71 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  51.65 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  52.92 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  52.92 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  53.68 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  52.92 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  52.92 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  53.39 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  52.92 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  52.63 
 
 		 368 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  52.92 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  52.06 
 
 		 363 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  51.91 
 
 		 361 aa  364  1e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  53.1 
 
 		 346 aa  364  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  54.03 
 
 		 336 aa  362  6e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  51.91 
 
 		 362 aa  360  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 		 368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  51.32 
 
 		 363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  52.85 
 
 		 355 aa  353  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  52.12 
 
 		 358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  51.75 
 
 		 356 aa  352  4e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  51.69 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  50.3 
 
 		 359 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  52.62 
 
 		 344 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  49.4 
 
 		 348 aa  336  2.9999999999999997e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  48.79 
 
 		 352 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  47.6 
 
 		 353 aa  334  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  47.9 
 
 		 353 aa  334  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  49.06 
 
 		 353 aa  334  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 		 353 aa  332  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  49.09 
 
 		 352 aa  332  7.000000000000001e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  48.47 
 
 		 352 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  48.48 
 
 		 391 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  48.63 
 
 		 353 aa  328  9e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  48.18 
 
 		 388 aa  324  1e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  48.54 
 
 		 337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  48.21 
 
 		 344 aa  319  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  48.33 
 
 		 339 aa  296  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  49.34 
 
 		 352 aa  295  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  44.41 
 
 		 358 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  43.79 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  46.84 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  37.46 
 
 		 364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  38.55 
 
 		 401 aa  239  6.999999999999999e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  37.61 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  36.42 
 
 		 338 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  39.1 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  35.96 
 
 		 355 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  37.09 
 
 		 341 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  36.55 
 
 		 355 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02490  conserved hypothetical protein  36.24 
 
 		 428 aa  209  5e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  38.15 
 
 		 354 aa  208  9e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  35.78 
 
 		 356 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  41.29 
 
 		 264 aa  206  5e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  40.37 
 
 		 353 aa  205  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  37.17 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  35.48 
 
 		 356 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  35.48 
 
 		 355 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  38.04 
 
 		 315 aa  202  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  34.68 
 
 		 355 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  35.67 
 
 		 359 aa  199  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  36.42 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  35.51 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  35.38 
 
 		 353 aa  196  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  34.11 
 
 		 355 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  33.63 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  33.92 
 
 		 355 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  37.24 
 
 		 339 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  35.73 
 
 		 356 aa  193  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  33.63 
 
 		 355 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  35.19 
 
 		 349 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  36.28 
 
 		 347 aa  192  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  34.71 
 
 		 348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>