236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3209 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  94.03 
 
 		 352 aa  694    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 391 aa  806    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  83.91 
 
 		 352 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  81.03 
 
 		 352 aa  599  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  79.43 
 
 		 353 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  64.27 
 
 		 359 aa  467  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  59.83 
 
 		 364 aa  453  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  60.23 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  61.89 
 
 		 352 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  58.57 
 
 		 354 aa  426  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  57.62 
 
 		 388 aa  420  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  56.94 
 
 		 348 aa  411  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  56.13 
 
 		 362 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  56.13 
 
 		 362 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  55.3 
 
 		 358 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  54.86 
 
 		 358 aa  391  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  53.85 
 
 		 358 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  56.16 
 
 		 368 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  52.94 
 
 		 361 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  55.59 
 
 		 368 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  54.49 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  54.15 
 
 		 353 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  54.73 
 
 		 353 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  53.69 
 
 		 368 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  53.22 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  58.99 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  52.38 
 
 		 361 aa  371  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  52.99 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  52.99 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  52.99 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  52.99 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  52.99 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  53.22 
 
 		 361 aa  371  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  52.99 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  51.93 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  52.71 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  52.71 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  51.54 
 
 		 362 aa  357  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  53.6 
 
 		 353 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  50 
 
 		 363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  50.42 
 
 		 363 aa  339  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  49.86 
 
 		 363 aa  334  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  48.63 
 
 		 344 aa  330  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  48.48 
 
 		 345 aa  328  9e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  49.08 
 
 		 342 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  47.83 
 
 		 356 aa  324  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  47.87 
 
 		 343 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  47.77 
 
 		 343 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  48.47 
 
 		 357 aa  316  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  48.18 
 
 		 343 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  47.31 
 
 		 354 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  48.18 
 
 		 343 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  48.18 
 
 		 343 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  47.85 
 
 		 343 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  46.95 
 
 		 343 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  48.9 
 
 		 343 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  45.65 
 
 		 353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  48.57 
 
 		 346 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  45.73 
 
 		 344 aa  305  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  46.18 
 
 		 344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  48.25 
 
 		 346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  46.22 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  47.15 
 
 		 352 aa  298  8e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  44.59 
 
 		 337 aa  296  5e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  46.73 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  43.59 
 
 		 358 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  46.13 
 
 		 339 aa  270  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  43.45 
 
 		 358 aa  265  7e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  39.09 
 
 		 364 aa  239  6.999999999999999e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0403488 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  37.47 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  45.03 
 
 		 337 aa  229  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  39.27 
 
 		 349 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  40.87 
 
 		 341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  39.56 
 
 		 344 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  40.89 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  40.13 
 
 		 356 aa  212  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  34.13 
 
 		 401 aa  211  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  39.23 
 
 		 354 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  38.34 
 
 		 353 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  40.19 
 
 		 344 aa  210  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  37.31 
 
 		 355 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  38.08 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  36.62 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  37.23 
 
 		 338 aa  201  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  37.15 
 
 		 355 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  37.46 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  36.86 
 
 		 355 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  38.02 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  38.66 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  36.39 
 
 		 356 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  36.71 
 
 		 355 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  36.77 
 
 		 348 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  35.96 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  39.94 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  35.92 
 
 		 351 aa  190  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  36.08 
 
 		 356 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  34.82 
 
 		 350 aa  189  7e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  35.38 
 
 		 355 aa  189  9e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  42.02 
 
 		 264 aa  188  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>