228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3460 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
344 aa  677    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  60.82 
 
 
339 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  60.06 
 
 
341 aa  362  6e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  59.7 
 
 
354 aa  361  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  56.12 
 
 
338 aa  361  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  59.58 
 
 
356 aa  353  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  52.54 
 
 
338 aa  328  8e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  54.68 
 
 
315 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  56.65 
 
 
353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  51.1 
 
 
359 aa  311  9e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  51.91 
 
 
349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  54.55 
 
 
338 aa  301  8.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  48.1 
 
 
451 aa  297  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  51.17 
 
 
350 aa  295  8e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  52.41 
 
 
344 aa  287  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  46.76 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  42.59 
 
 
344 aa  256  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1204  aminoglycoside phosphotransferase  46.15 
 
 
340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  45.37 
 
 
348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  44.09 
 
 
339 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  43.7 
 
 
351 aa  250  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  45.03 
 
 
338 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  45.03 
 
 
338 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  45.03 
 
 
338 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  42.14 
 
 
339 aa  235  8e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  42.09 
 
 
348 aa  227  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  40.71 
 
 
357 aa  227  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  45 
 
 
362 aa  226  4e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  40.51 
 
 
352 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  37.15 
 
 
351 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  42.38 
 
 
353 aa  219  5e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  40.97 
 
 
356 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  37.18 
 
 
355 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  40.48 
 
 
361 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  39.44 
 
 
363 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  41.72 
 
 
352 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  40.32 
 
 
356 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  38.41 
 
 
355 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  40.07 
 
 
350 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  39.56 
 
 
391 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  37.89 
 
 
355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  44.9 
 
 
348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  40.27 
 
 
354 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  37.35 
 
 
354 aa  212  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  39.88 
 
 
358 aa  212  7.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  38.71 
 
 
352 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  41.9 
 
 
348 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  40.06 
 
 
358 aa  212  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  38.91 
 
 
355 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  36.68 
 
 
352 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  44.52 
 
 
352 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  36.9 
 
 
355 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  39.03 
 
 
353 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  40.4 
 
 
357 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  39.75 
 
 
379 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  37.17 
 
 
345 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  39 
 
 
355 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  37.94 
 
 
388 aa  203  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  42.48 
 
 
349 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  39 
 
 
355 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  40.91 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  39.04 
 
 
344 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  35.22 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  37.69 
 
 
358 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18680  predicted aminoglycoside phosphotransferase  39.62 
 
 
357 aa  200  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.571289 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  39.55 
 
 
368 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  38.63 
 
 
359 aa  199  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  39.23 
 
 
368 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  39.17 
 
 
353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  39.03 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  36.71 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  38.99 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  37.15 
 
 
346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  36.84 
 
 
346 aa  196  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 
361 aa  195  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  37.84 
 
 
344 aa  195  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  37 
 
 
358 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  37.81 
 
 
364 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.82 
 
 
815 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  37.67 
 
 
403 aa  194  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  40.86 
 
 
362 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  36.51 
 
 
362 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  36.51 
 
 
362 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  34.91 
 
 
380 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  40.26 
 
 
368 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  38.97 
 
 
365 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0618  putative phosphotransferase  38.65 
 
 
350 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172758  normal  0.0703036 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  34.41 
 
 
344 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  36.88 
 
 
354 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  36.83 
 
 
358 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  36.51 
 
 
429 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  39.33 
 
 
361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  39 
 
 
361 aa  189  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  37.12 
 
 
353 aa  189  7e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  37.38 
 
 
354 aa  189  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1885  aminoglycoside phosphotransferase  40.52 
 
 
354 aa  189  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  37.89 
 
 
337 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  36.28 
 
 
361 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  36.48 
 
 
356 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  37.76 
 
 
342 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>