232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0182 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
339 aa  691    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  61.89 
 
 
358 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  58.36 
 
 
358 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  56.86 
 
 
344 aa  355  5e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  54.22 
 
 
344 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  49.54 
 
 
362 aa  338  9e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  49.54 
 
 
362 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  56.19 
 
 
346 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  51.07 
 
 
358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  52.98 
 
 
346 aa  334  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  50.6 
 
 
359 aa  332  8e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  48.93 
 
 
358 aa  325  7e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  50.15 
 
 
368 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  48.35 
 
 
358 aa  322  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  49.71 
 
 
361 aa  318  7.999999999999999e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  47.59 
 
 
354 aa  318  9e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  58.6 
 
 
337 aa  317  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  47.73 
 
 
345 aa  317  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  49.85 
 
 
368 aa  316  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  47.2 
 
 
356 aa  315  5e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  44.91 
 
 
364 aa  315  6e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  50.31 
 
 
361 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  49.69 
 
 
337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 
361 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  48.39 
 
 
361 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  49.25 
 
 
368 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  50.79 
 
 
353 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  48.48 
 
 
363 aa  311  9e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  45.75 
 
 
344 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  46.91 
 
 
354 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  48.78 
 
 
363 aa  309  5e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  47.97 
 
 
361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  48.66 
 
 
368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  48.66 
 
 
368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  48.66 
 
 
368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  48.66 
 
 
368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  48.66 
 
 
368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  48.66 
 
 
368 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  46.33 
 
 
363 aa  301  7.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  48.37 
 
 
368 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  48.37 
 
 
368 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  49.53 
 
 
362 aa  299  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  46.13 
 
 
368 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  47.9 
 
 
355 aa  292  7e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  46.55 
 
 
342 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  48.33 
 
 
343 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  47.13 
 
 
352 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  48.34 
 
 
343 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  44.87 
 
 
352 aa  288  6e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  44.68 
 
 
358 aa  287  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  48.33 
 
 
343 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  48.02 
 
 
343 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  48.33 
 
 
343 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  48.33 
 
 
343 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  44.68 
 
 
388 aa  286  4e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  45.2 
 
 
391 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  47.56 
 
 
357 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  46.15 
 
 
353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  44.21 
 
 
344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  44.58 
 
 
352 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  46.15 
 
 
343 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  46.81 
 
 
353 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  43.29 
 
 
352 aa  279  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  45.32 
 
 
348 aa  279  6e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  45.9 
 
 
353 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  45.12 
 
 
343 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  47.99 
 
 
352 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  43.25 
 
 
353 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  44.94 
 
 
336 aa  264  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  38.08 
 
 
382 aa  227  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  40.18 
 
 
338 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  39.82 
 
 
359 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  40.96 
 
 
356 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  37.58 
 
 
401 aa  208  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  40.24 
 
 
354 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  39.58 
 
 
349 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  35.67 
 
 
364 aa  204  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  38.2 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  38.15 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  40.88 
 
 
344 aa  200  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  37.8 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  37.46 
 
 
341 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  36 
 
 
355 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  37.23 
 
 
339 aa  195  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  36.01 
 
 
353 aa  192  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  37.01 
 
 
355 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  35.56 
 
 
353 aa  188  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  36.42 
 
 
356 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  36.11 
 
 
356 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  38.24 
 
 
315 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  39.74 
 
 
353 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  33.99 
 
 
348 aa  186  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  34.38 
 
 
355 aa  185  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 
355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  33.11 
 
 
348 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  35.89 
 
 
355 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  35.37 
 
 
350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  35.09 
 
 
355 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>